More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4261 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
652 aa  1311    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.84 
 
 
642 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.95 
 
 
623 aa  243  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.46 
 
 
659 aa  236  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 
662 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 
662 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 
662 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.03 
 
 
656 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.11 
 
 
653 aa  230  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26 
 
 
654 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.48 
 
 
634 aa  227  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.99 
 
 
662 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.85 
 
 
632 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
655 aa  220  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
645 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  28.11 
 
 
645 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 
654 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  26.93 
 
 
649 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.89 
 
 
645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  26.65 
 
 
640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.68 
 
 
644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.37 
 
 
649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
661 aa  213  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
645 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.14 
 
 
662 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  26.28 
 
 
662 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  30.99 
 
 
648 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  26.17 
 
 
653 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.14 
 
 
661 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.56 
 
 
657 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.27 
 
 
654 aa  207  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.97 
 
 
650 aa  207  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
665 aa  200  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.15 
 
 
755 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.13 
 
 
644 aa  197  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.33 
 
 
688 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.22 
 
 
665 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  26.92 
 
 
759 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.33 
 
 
632 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.65 
 
 
665 aa  190  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
705 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.5 
 
 
656 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.3 
 
 
646 aa  187  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  26.92 
 
 
636 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.98 
 
 
642 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
641 aa  179  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.4 
 
 
646 aa  177  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.56 
 
 
666 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.91 
 
 
682 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
632 aa  170  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.84 
 
 
924 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.19 
 
 
655 aa  167  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.72 
 
 
645 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.53 
 
 
630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.18 
 
 
685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  35.04 
 
 
665 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.24 
 
 
626 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.78 
 
 
907 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.06 
 
 
688 aa  163  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.62 
 
 
626 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.22 
 
 
706 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.07 
 
 
631 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.26 
 
 
626 aa  160  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.26 
 
 
626 aa  160  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.36 
 
 
626 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.79 
 
 
636 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  28.21 
 
 
694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.36 
 
 
642 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.55 
 
 
662 aa  154  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.63 
 
 
629 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.32 
 
 
686 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  27.53 
 
 
634 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.46 
 
 
629 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.68 
 
 
686 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.79 
 
 
731 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.96 
 
 
644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.42 
 
 
629 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.8 
 
 
644 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.2 
 
 
633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  27.02 
 
 
681 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.25 
 
 
677 aa  127  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  26.97 
 
 
651 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  33.05 
 
 
665 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.07 
 
 
597 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.48 
 
 
606 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.64 
 
 
644 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.28 
 
 
607 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.66 
 
 
617 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  28.2 
 
 
608 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.71 
 
 
668 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.18 
 
 
643 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.64 
 
 
692 aa  125  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.4 
 
 
644 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.11 
 
 
642 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.4 
 
 
644 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.56 
 
 
607 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.77 
 
 
642 aa  124  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  28.52 
 
 
608 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  29.89 
 
 
612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>