More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4618 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  85.58 
 
 
645 aa  1153    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
645 aa  1333    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  85.27 
 
 
645 aa  1151    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  91.47 
 
 
645 aa  1209    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.49 
 
 
644 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  85.27 
 
 
645 aa  1154    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.2 
 
 
634 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.95 
 
 
656 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.5 
 
 
665 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.28 
 
 
655 aa  265  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  31.91 
 
 
640 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
665 aa  259  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
645 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  28.99 
 
 
665 aa  250  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.59 
 
 
657 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.26 
 
 
642 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.81 
 
 
688 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.19 
 
 
662 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 
662 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 
662 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.99 
 
 
662 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.64 
 
 
632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.73 
 
 
656 aa  240  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.26 
 
 
653 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
662 aa  237  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.95 
 
 
649 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.73 
 
 
654 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.74 
 
 
632 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.15 
 
 
654 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.34 
 
 
924 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.88 
 
 
644 aa  230  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.02 
 
 
655 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.62 
 
 
705 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.82 
 
 
650 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.73 
 
 
907 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.03 
 
 
646 aa  227  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 
659 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  28.33 
 
 
636 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.77 
 
 
685 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  28.62 
 
 
653 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  27.5 
 
 
662 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  26.96 
 
 
642 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.33 
 
 
755 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.62 
 
 
649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.35 
 
 
661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.19 
 
 
629 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.72 
 
 
688 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.04 
 
 
677 aa  216  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
652 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.47 
 
 
654 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.73 
 
 
706 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.93 
 
 
653 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
662 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.81 
 
 
661 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.18 
 
 
642 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  28.79 
 
 
759 aa  210  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.85 
 
 
631 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.54 
 
 
630 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.59 
 
 
648 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  35.1 
 
 
634 aa  204  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 
682 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.3 
 
 
646 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.32 
 
 
626 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.88 
 
 
629 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.07 
 
 
686 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.06 
 
 
626 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.05 
 
 
636 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.56 
 
 
665 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.72 
 
 
623 aa  190  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  27.19 
 
 
681 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.24 
 
 
641 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.41 
 
 
686 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  26.99 
 
 
694 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.01 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.79 
 
 
666 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.01 
 
 
626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
626 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.61 
 
 
731 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.33 
 
 
632 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.22 
 
 
617 aa  158  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.64 
 
 
650 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.41 
 
 
692 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.96 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  29.47 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.85 
 
 
600 aa  137  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.79 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.17 
 
 
668 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.98 
 
 
678 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.28 
 
 
634 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.47 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 
708 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  34.48 
 
 
665 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
628 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.29 
 
 
594 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  34.84 
 
 
661 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.63 
 
 
633 aa  125  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.74 
 
 
677 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.65 
 
 
615 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  29.58 
 
 
638 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 
655 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>