More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0301 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  60.48 
 
 
636 aa  764    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  59.07 
 
 
641 aa  701    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  99.52 
 
 
626 aa  1251    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
626 aa  1257    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  95.85 
 
 
626 aa  1215    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  54.44 
 
 
632 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  45.63 
 
 
731 aa  588  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  50.24 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.72 
 
 
630 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  43.85 
 
 
646 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  43.73 
 
 
907 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  41.85 
 
 
681 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.38 
 
 
924 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.4 
 
 
706 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.03 
 
 
626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.45 
 
 
705 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.1 
 
 
631 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.76 
 
 
626 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.97 
 
 
629 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  39.71 
 
 
634 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.73 
 
 
644 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.56 
 
 
650 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.94 
 
 
632 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.63 
 
 
629 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  35.06 
 
 
640 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  34.43 
 
 
655 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.79 
 
 
642 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.28 
 
 
688 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.25 
 
 
682 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.63 
 
 
686 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  31.68 
 
 
759 aa  300  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.07 
 
 
655 aa  299  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.44 
 
 
686 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
666 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.89 
 
 
638 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.26 
 
 
656 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30 
 
 
615 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.86 
 
 
632 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  29.93 
 
 
678 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  30.32 
 
 
657 aa  237  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.71 
 
 
652 aa  227  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 
665 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  28.95 
 
 
638 aa  217  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.93 
 
 
600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.42 
 
 
653 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  27.56 
 
 
642 aa  203  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.07 
 
 
665 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.44 
 
 
657 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.55 
 
 
648 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.98 
 
 
610 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  25.45 
 
 
596 aa  193  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.44 
 
 
597 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.68 
 
 
659 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.67 
 
 
656 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.07 
 
 
623 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.51 
 
 
645 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.55 
 
 
649 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  31.27 
 
 
665 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.42 
 
 
644 aa  184  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
649 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.48 
 
 
638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.17 
 
 
650 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.49 
 
 
642 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.12 
 
 
645 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.41 
 
 
588 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.12 
 
 
645 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.8 
 
 
645 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 
657 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
662 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.14 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.21 
 
 
594 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  33.01 
 
 
645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.12 
 
 
653 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.54 
 
 
645 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.04 
 
 
661 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.62 
 
 
662 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.07 
 
 
661 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.62 
 
 
662 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.97 
 
 
654 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.32 
 
 
665 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.27 
 
 
654 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
688 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.48 
 
 
612 aa  170  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  25.57 
 
 
662 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.46 
 
 
662 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.72 
 
 
634 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  39.19 
 
 
649 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
646 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.27 
 
 
755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.08 
 
 
605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
695 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.84 
 
 
607 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.86 
 
 
776 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.44 
 
 
653 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.9 
 
 
628 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.26 
 
 
652 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.12 
 
 
685 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.96 
 
 
596 aa  158  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>