More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0448 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  55.23 
 
 
638 aa  728    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.38 
 
 
657 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  50.74 
 
 
615 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.63 
 
 
652 aa  1154    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  57.85 
 
 
653 aa  759    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  62.79 
 
 
657 aa  875    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  100 
 
 
678 aa  1399    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.5 
 
 
638 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.73 
 
 
596 aa  316  9e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.61 
 
 
594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.9 
 
 
588 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.42 
 
 
656 aa  303  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.87 
 
 
628 aa  296  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.28 
 
 
907 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.65 
 
 
612 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.41 
 
 
611 aa  293  9e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.76 
 
 
610 aa  280  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31 
 
 
924 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.48 
 
 
600 aa  266  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.25 
 
 
705 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  28.59 
 
 
640 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.19 
 
 
642 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 
655 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
632 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.66 
 
 
597 aa  256  9e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.48 
 
 
630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  31.71 
 
 
674 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.86 
 
 
641 aa  248  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.42 
 
 
646 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  30.51 
 
 
694 aa  247  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.43 
 
 
706 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.21 
 
 
651 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.11 
 
 
653 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  28.3 
 
 
759 aa  243  7e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1815  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.77 
 
 
653 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.4 
 
 
731 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.73 
 
 
653 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.1 
 
 
626 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.93 
 
 
626 aa  238  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.26 
 
 
626 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29 
 
 
695 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.98 
 
 
644 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  28.9 
 
 
596 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  28.74 
 
 
681 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.1 
 
 
607 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.29 
 
 
636 aa  230  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.19 
 
 
682 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.45 
 
 
638 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
666 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.79 
 
 
632 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.55 
 
 
621 aa  219  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.22 
 
 
686 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
571 aa  208  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
655 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  29.11 
 
 
634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.11 
 
 
686 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.65 
 
 
588 aa  194  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.79 
 
 
572 aa  194  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 
626 aa  193  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.55 
 
 
629 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.21 
 
 
617 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0382  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0110228  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.14 
 
 
629 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.61 
 
 
626 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  29.97 
 
 
649 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 
634 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.92 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.66 
 
 
632 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.73 
 
 
628 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.68 
 
 
656 aa  170  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.51 
 
 
668 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.07 
 
 
652 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.07 
 
 
652 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.07 
 
 
652 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.98 
 
 
776 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.72 
 
 
644 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.88 
 
 
650 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.71 
 
 
633 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.73 
 
 
635 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4095  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.03 
 
 
620 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 
735 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.81 
 
 
619 aa  151  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0440  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 
536 aa  150  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.94 
 
 
665 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.77 
 
 
683 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
655 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.96 
 
 
606 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.9 
 
 
659 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.26 
 
 
642 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.72 
 
 
680 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
623 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.79 
 
 
657 aa  144  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.62 
 
 
656 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.03 
 
 
665 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  28.65 
 
 
691 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.92 
 
 
662 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.44 
 
 
689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>