More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0061 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
653 aa  1347    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.95 
 
 
645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.5 
 
 
642 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.44 
 
 
645 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  28.62 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.71 
 
 
645 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29 
 
 
644 aa  231  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.16 
 
 
662 aa  219  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.49 
 
 
755 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.45 
 
 
685 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.83 
 
 
634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.53 
 
 
688 aa  201  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 
665 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  25.56 
 
 
642 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.2 
 
 
649 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.73 
 
 
653 aa  188  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.36 
 
 
654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.38 
 
 
662 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.38 
 
 
662 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.38 
 
 
662 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.75 
 
 
662 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.04 
 
 
629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.54 
 
 
661 aa  180  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  30.39 
 
 
662 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  29.78 
 
 
636 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.09 
 
 
665 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.27 
 
 
662 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.43 
 
 
659 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  23.49 
 
 
665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  29.87 
 
 
649 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
654 aa  174  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  29.14 
 
 
653 aa  174  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.87 
 
 
631 aa  173  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.25 
 
 
642 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
657 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.73 
 
 
661 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.71 
 
 
650 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 
654 aa  171  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
692 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.59 
 
 
924 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
623 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.64 
 
 
626 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.36 
 
 
688 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.09 
 
 
646 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.22 
 
 
682 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.68 
 
 
648 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.99 
 
 
907 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
656 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.64 
 
 
630 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.98 
 
 
665 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.04 
 
 
626 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.48 
 
 
686 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.42 
 
 
705 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  29.19 
 
 
655 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.18 
 
 
686 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  27.65 
 
 
640 aa  153  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.67 
 
 
656 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.06 
 
 
629 aa  150  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  28.65 
 
 
634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.81 
 
 
655 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  26.75 
 
 
694 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.32 
 
 
632 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.3 
 
 
652 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  31.76 
 
 
681 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.13 
 
 
644 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.14 
 
 
706 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.62 
 
 
632 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  27.45 
 
 
759 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.9 
 
 
677 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.84 
 
 
626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.84 
 
 
626 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.37 
 
 
626 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.63 
 
 
636 aa  127  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.68 
 
 
731 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
632 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
646 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.46 
 
 
641 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.1 
 
 
650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.03 
 
 
597 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  28.57 
 
 
596 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
646 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.86 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.87 
 
 
666 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.14 
 
 
643 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.87 
 
 
634 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 
683 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.7 
 
 
596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  32.77 
 
 
608 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2548  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.08 
 
 
644 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152955  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.81 
 
 
644 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.7 
 
 
644 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.7 
 
 
644 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.22 
 
 
682 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.22 
 
 
682 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.22 
 
 
682 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.22 
 
 
682 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.3 
 
 
674 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.89 
 
 
615 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>