More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0056 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  100 
 
 		 4630 aa  9181    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  32.38 
 
 		 1300 aa  249  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  46.24 
 
 		 710 aa  183  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.11 
 
 		 1821 aa  148  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.2 
 
 		 1279 aa  141  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.97 
 
 		 1009 aa  139  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  40 
 
 		 1208 aa  138  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  29.5 
 
 		 526 aa  137  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  35.75 
 
 		 506 aa  129  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.99 
 
 		 685 aa  128  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  36.45 
 
 		 629 aa  126  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  38.29 
 
 		 625 aa  125  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  39.41 
 
 		 457 aa  124  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35.14 
 
 		 921 aa  122  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  34.09 
 
 		 758 aa  121  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  36.93 
 
 		 518 aa  120  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.4 
 
 		 1361 aa  119  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  35.43 
 
 		 920 aa  117  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  33.49 
 
 		 820 aa  117  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 		 1328 aa  116  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.58 
 
 		 926 aa  115  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 223 aa  114  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  33.91 
 
 		 1226 aa  114  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  37.16 
 
 		 767 aa  114  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  33.96 
 
 		 1048 aa  114  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  36.05 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.43 
 
 		 1029 aa  112  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  34.22 
 
 		 573 aa  112  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.21 
 
 		 570 aa  112  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.98 
 
 		 693 aa  112  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  35.67 
 
 		 288 aa  111  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  36.78 
 
 		 548 aa  110  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 		 1321 aa  108  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1194 aa  108  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.79 
 
 		 2042 aa  107  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  32.96 
 
 		 657 aa  106  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  35 
 
 		 1168 aa  106  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.63 
 
 		 3027 aa  106  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  32.56 
 
 		 660 aa  105  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 		 1234 aa  106  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  30.81 
 
 		 1081 aa  105  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  30.19 
 
 		 631 aa  105  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.52 
 
 		 932 aa  105  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  32.97 
 
 		 506 aa  105  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.47 
 
 		 1174 aa  104  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.49 
 
 		 1710 aa  103  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.39 
 
 		 995 aa  103  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  25.16 
 
 		 1316 aa  102  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.13 
 
 		 1013 aa  102  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.32 
 
 		 1495 aa  101  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.07 
 
 		 1847 aa  100  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  36.88 
 
 		 981 aa  100  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  30.39 
 
 		 1154 aa  98.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  36.87 
 
 		 748 aa  97.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 857 aa  97.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  31.28 
 
 		 542 aa  95.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  32.75 
 
 		 1223 aa  95.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.18 
 
 		 688 aa  94.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  30.34 
 
 		 604 aa  94.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 939 aa  94  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  31.18 
 
 		 914 aa  94  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  26.67 
 
 		 693 aa  94  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.99 
 
 		 530 aa  93.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1260 aa  92.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.22 
 
 		 1661 aa  92.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 640 aa  92  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.32 
 
 		 2313 aa  91.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.34 
 
 		 410 aa  91.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 1231 aa  90.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  28.81 
 
 		 834 aa  90.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  33.52 
 
 		 286 aa  90.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 		 1054 aa  89.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  31.67 
 
 		 805 aa  89.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.35 
 
 		 1016 aa  89.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  31.76 
 
 		 218 aa  89.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  30.18 
 
 		 472 aa  89.4  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  31.35 
 
 		 396 aa  89.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  37.93 
 
 		 437 aa  88.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  27.72 
 
 		 935 aa  89  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1756 aa  89  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  28.5 
 
 		 754 aa  88.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  29.03 
 
 		 472 aa  88.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  30.65 
 
 		 413 aa  88.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  29.26 
 
 		 548 aa  88.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  30.64 
 
 		 819 aa  87.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000842335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  28.14 
 
 		 1421 aa  87.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  30.94 
 
 		 756 aa  87.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  32.51 
 
 		 399 aa  87  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.83 
 
 		 558 aa  87  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  27.62 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 692 aa  86.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  31.91 
 
 		 669 aa  86.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  28.4 
 
 		 546 aa  86.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.7 
 
 		 447 aa  85.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  27.62 
 
 		 552 aa  84.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  30.74 
 
 		 892 aa  84  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  28.8 
 
 		 880 aa  83.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1008  cell-wall amidase, pXO2-42-like protein  31.28 
 
 		 342 aa  83.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  24.05 
 
 		 1518 aa  83.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  25.4 
 
 		 799 aa  83.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>