230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2917 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 805 aa  1608    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 748 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  35.29 
 
 		 834 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  29.62 
 
 		 455 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.91 
 
 		 926 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  28.25 
 
 		 546 aa  90.9  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.24 
 
 		 1328 aa  90.9  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.67 
 
 		 4630 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  29.58 
 
 		 920 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.4 
 
 		 1226 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  31.67 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  29.28 
 
 		 1223 aa  84  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.43 
 
 		 629 aa  84  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  29.38 
 
 		 1208 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  24.22 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  28.08 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  24.52 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.86 
 
 		 685 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  28.5 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  28.29 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.39 
 
 		 693 aa  77  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  28.32 
 
 		 710 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  27.51 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  27.94 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  31.79 
 
 		 1081 aa  75.1  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.47 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 		 1234 aa  73.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  26.74 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 1321 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  21.84 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  23.58 
 
 		 1154 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  27.06 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  40.57 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  28.65 
 
 		 932 aa  67.8  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1194 aa  68.2  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  29.55 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.61 
 
 		 914 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.61 
 
 		 939 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1260 aa  65.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  28.73 
 
 		 1013 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  41.56 
 
 		 2117 aa  64.7  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  34.21 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  28.65 
 
 		 1174 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  32.18 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  25.35 
 
 		 1495 aa  64.7  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  25.71 
 
 		 935 aa  64.3  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  25 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  28.98 
 
 		 1168 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 		 995 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  36.11 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  25.27 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  26.98 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  28.42 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  26.8 
 
 		 2207 aa  62.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  26.55 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.54 
 
 		 6885 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  24.13 
 
 		 585 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.41 
 
 		 572 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  24.38 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  28.35 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.64 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.41 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  24.38 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  30.37 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.64 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  26.24 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  25.24 
 
 		 1710 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.78 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  26.14 
 
 		 1821 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  25.77 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  35.34 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  35.34 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 1847 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.44 
 
 		 1661 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  24.31 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  27.62 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  24.67 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.92 
 
 		 1231 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  23.7 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  27.53 
 
 		 631 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  35.09 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.26 
 
 		 1016 aa  57.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.47 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  24.87 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  24.44 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.79 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  26.7 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.47 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  24.88 
 
 		 461 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  24.38 
 
 		 697 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  24 
 
 		 620 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.47 
 
 		 575 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  34.74 
 
 		 631 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  24.15 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  22.94 
 
 		 594 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  24.15 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>