237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1742 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1026    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  29.74 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  30.02 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  24.72 
 
 		 748 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  25.56 
 
 		 834 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  26.96 
 
 		 546 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  28.65 
 
 		 693 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  29.63 
 
 		 660 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  26.88 
 
 		 1154 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  29.73 
 
 		 767 aa  87  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.38 
 
 		 629 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  30.32 
 
 		 921 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  28.28 
 
 		 685 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  31.58 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  26.26 
 
 		 710 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  23.74 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  28.88 
 
 		 1226 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1194 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  26.23 
 
 		 4630 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  28.88 
 
 		 1208 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  25.63 
 
 		 926 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  28.26 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  24.87 
 
 		 1009 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 631 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  27.27 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  27.72 
 
 		 1223 aa  74.3  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  25.32 
 
 		 288 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  25.4 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  24.86 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  24.62 
 
 		 657 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  25.41 
 
 		 625 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  27.72 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  26.2 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  24.78 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  24.16 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  25.62 
 
 		 920 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  24.61 
 
 		 1821 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  23.86 
 
 		 693 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  28.65 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  26.7 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 223 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  27.72 
 
 		 1847 aa  66.6  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  27.27 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  27.42 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  22.95 
 
 		 758 aa  65.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  24.88 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  30 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  28.42 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1932  S-layer-like domain-containing protein  25.13 
 
 		 1001 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.446643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  24.72 
 
 		 932 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  23.81 
 
 		 834 aa  63.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  27.72 
 
 		 1081 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 995 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2633  S-layer domain protein  21.53 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.82 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  24.06 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.97 
 
 		 2313 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.63 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  26.7 
 
 		 1710 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  24.73 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.28 
 
 		 1054 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 		 1321 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.21 
 
 		 1016 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3132  S-layer domain protein  20.67 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000238751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  34.18 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  27.68 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  32.67 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0851  S-layer domain-containing protein  29.23 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  31.68 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  31.68 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  31.68 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  31.68 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.83 
 
 		 1328 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  24.32 
 
 		 1174 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  35.44 
 
 		 502 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  26.26 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1025  S-layer protein  26.36 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  23.74 
 
 		 558 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  23.56 
 
 		 521 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.13 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.97 
 
 		 1234 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  25.47 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  32.91 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  28 
 
 		 1756 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 857 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.64 
 
 		 6885 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  24.08 
 
 		 717 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1260 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  21.79 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  28.95 
 
 		 257 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  22.68 
 
 		 733 aa  53.5  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  33.08 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  27.47 
 
 		 807 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  32.33 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  24.46 
 
 		 914 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  20.51 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  27.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  52.08 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>