214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2478 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  778    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  44.57 
 
 		 570 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  29.39 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  35.82 
 
 		 748 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  29.44 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  25.36 
 
 		 834 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  31.66 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  28.5 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.15 
 
 		 629 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  28.08 
 
 		 805 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  26.29 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  27.42 
 
 		 1208 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.08 
 
 		 693 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  28.65 
 
 		 1154 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  28.72 
 
 		 1223 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  25.67 
 
 		 4630 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  27.55 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 1321 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  28.16 
 
 		 1821 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.35 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.59 
 
 		 926 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  26.88 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.6 
 
 		 1328 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.37 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 1029 aa  70.1  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  30.21 
 
 		 546 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2344  S-layer domain-containing protein  27.13 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  25.97 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1194 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.89 
 
 		 1234 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  27.5 
 
 		 693 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  26.18 
 
 		 758 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  28.64 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  29.57 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  26.73 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  28.86 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.06 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  25.89 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.53 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.53 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.53 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.53 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  28.37 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  26.5 
 
 		 1710 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  27.68 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.18 
 
 		 1013 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  27.41 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1742  hypothetical protein  25.66 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000668238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  27.5 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  25.87 
 
 		 554 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  43.14 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  27.01 
 
 		 935 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.13 
 
 		 1661 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.89 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  24.87 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  31.39 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  23.92 
 
 		 1421 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  25.13 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.57 
 
 		 6885 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  29.52 
 
 		 1168 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  25 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  27.75 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  25.44 
 
 		 1226 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  27.27 
 
 		 2117 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.12 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.12 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  25.51 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  31.78 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 692 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.13 
 
 		 1016 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  28.28 
 
 		 669 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.24 
 
 		 599 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  23.74 
 
 		 1495 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.24 
 
 		 599 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.37 
 
 		 1231 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  44.23 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  26.55 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.75 
 
 		 1174 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.49 
 
 		 567 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  27.78 
 
 		 717 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  27.78 
 
 		 932 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1260 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  23.2 
 
 		 463 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  35.29 
 
 		 361 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.6 
 
 		 3027 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.14 
 
 		 572 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  32.43 
 
 		 506 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  27.85 
 
 		 1050 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  22 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  26.82 
 
 		 618 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  28.08 
 
 		 880 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26 
 
 		 575 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  25 
 
 		 939 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 		 995 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  26.29 
 
 		 807 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  29.6 
 
 		 733 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>