More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1307 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  100 
 
 		 631 aa  1267    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.61 
 
 		 6885 aa  308  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  39.69 
 
 		 2286 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.99 
 
 		 2073 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  34.47 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.74 
 
 		 2313 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  31.6 
 
 		 2375 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  32.54 
 
 		 609 aa  200  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  33.5 
 
 		 3320 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1457 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.5 
 
 		 1305 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  45.83 
 
 		 688 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  32.49 
 
 		 2207 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.19 
 
 		 1661 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  44.32 
 
 		 729 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  32.48 
 
 		 1729 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0735  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.59 
 
 		 268 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000183583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  41.27 
 
 		 1042 aa  137  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  42.94 
 
 		 930 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.59 
 
 		 618 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.49 
 
 		 1495 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  27.51 
 
 		 1847 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  38.24 
 
 		 935 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  30.33 
 
 		 756 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.6 
 
 		 1029 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.92 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.97 
 
 		 1016 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.84 
 
 		 1174 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  29.01 
 
 		 524 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  34.85 
 
 		 733 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  31.99 
 
 		 820 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 1013 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  34.48 
 
 		 1168 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  36.46 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1260 aa  100  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.34 
 
 		 693 aa  99.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.01 
 
 		 932 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  35.03 
 
 		 2178 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.81 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  31.69 
 
 		 414 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  34.64 
 
 		 880 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  33.91 
 
 		 518 aa  94  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  30.89 
 
 		 548 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  30.98 
 
 		 548 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 		 995 aa  92.8  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.4 
 
 		 1009 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  30.61 
 
 		 554 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.16 
 
 		 413 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  36.36 
 
 		 625 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.07 
 
 		 413 aa  91.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  36.13 
 
 		 1050 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.38 
 
 		 779 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.35 
 
 		 926 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.18 
 
 		 526 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1194 aa  88.2  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  30.86 
 
 		 594 aa  87.4  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  32.2 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 		 1054 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  31.07 
 
 		 669 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.94 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.36 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  32.04 
 
 		 754 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  30.18 
 
 		 920 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  32.04 
 
 		 1821 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  31.07 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  32.04 
 
 		 1226 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  32.43 
 
 		 1421 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  32 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.36 
 
 		 1321 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  31.35 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  31.74 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  28.25 
 
 		 693 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.9 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.9 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.9 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  30.9 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  31.84 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  29.57 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.33 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  33.73 
 
 		 876 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  30.34 
 
 		 807 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  31.11 
 
 		 1208 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  29.12 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.21 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  31.52 
 
 		 822 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.22 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  32.78 
 
 		 1710 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.94 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  30.05 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  29.79 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  30.05 
 
 		 814 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  30.05 
 
 		 814 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  26.86 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  25.68 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>