More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0130 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.82 
 
 
1328 aa  804    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  39.28 
 
 
1204 aa  720    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.28 
 
 
1234 aa  841    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1231 aa  2519    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  33.94 
 
 
1223 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.08 
 
 
1016 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  36.91 
 
 
1351 aa  268  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.94 
 
 
2552 aa  261  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  32.82 
 
 
697 aa  204  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
1726 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.62 
 
 
835 aa  202  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  34.07 
 
 
1748 aa  197  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  35.03 
 
 
1613 aa  191  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  34.87 
 
 
2030 aa  183  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.98 
 
 
1783 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 
866 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.55 
 
 
1773 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
1797 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 
1253 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.31 
 
 
2182 aa  115  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.43 
 
 
2171 aa  115  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.27 
 
 
685 aa  109  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  34.43 
 
 
921 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.48 
 
 
1239 aa  108  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  27.44 
 
 
903 aa  104  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  32.79 
 
 
1285 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  34.41 
 
 
920 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  28.27 
 
 
937 aa  101  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  38.33 
 
 
1208 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.2 
 
 
1172 aa  97.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.34 
 
 
1361 aa  97.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 
1106 aa  97.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.19 
 
 
1821 aa  97.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
327 aa  95.5  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  33.88 
 
 
710 aa  95.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  38.5 
 
 
767 aa  95.1  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.61 
 
 
1333 aa  93.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.68 
 
 
506 aa  92  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  39.02 
 
 
1226 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  34.57 
 
 
629 aa  90.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  31.18 
 
 
531 aa  89.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.68 
 
 
693 aa  89  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
576 aa  87.4  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  26.39 
 
 
925 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  38.26 
 
 
758 aa  86.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  41.44 
 
 
926 aa  85.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  39.29 
 
 
625 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
509 aa  84.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 
1234 aa  84  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.99 
 
 
1174 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.56 
 
 
4630 aa  83.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  32.97 
 
 
932 aa  82  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.32 
 
 
1230 aa  82  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  38.28 
 
 
364 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  30.45 
 
 
644 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  36.45 
 
 
1081 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.76 
 
 
820 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  27.27 
 
 
693 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  32.17 
 
 
548 aa  80.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.71 
 
 
1710 aa  79.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.35 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.74 
 
 
1153 aa  78.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.4 
 
 
1086 aa  78.2  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.77 
 
 
1241 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
999 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
412 aa  77.4  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.02 
 
 
1065 aa  78.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
432 aa  77.4  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  29.79 
 
 
1756 aa  78.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  30.39 
 
 
288 aa  77.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 
442 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  24.35 
 
 
2207 aa  77  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  37.61 
 
 
573 aa  77  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  27.14 
 
 
414 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  27.57 
 
 
552 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  40.57 
 
 
526 aa  76.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 
986 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  27.27 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.78 
 
 
935 aa  76.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  40.91 
 
 
1168 aa  76.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  31.15 
 
 
223 aa  76.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.37 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  26.05 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30 
 
 
1421 aa  75.1  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.06 
 
 
688 aa  75.1  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  29.89 
 
 
1194 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.62 
 
 
1013 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  33.77 
 
 
631 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  29.51 
 
 
286 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
1085 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  27.27 
 
 
457 aa  73.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  36.03 
 
 
756 aa  72.4  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  24.22 
 
 
1260 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  26.67 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.62 
 
 
1060 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 
1110 aa  72  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
1029 aa  72  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  29.03 
 
 
1009 aa  72  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 
1261 aa  72  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>