34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1484 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 937 aa  1926    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  33.47 
 
 		 903 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 1783 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 1773 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.05 
 
 		 1797 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.91 
 
 		 1231 aa  101  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.72 
 
 		 1328 aa  96.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  27.65 
 
 		 1351 aa  93.6  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  26.74 
 
 		 1223 aa  89.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.5 
 
 		 2552 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 		 1234 aa  80.1  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  24.1 
 
 		 697 aa  80.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.99 
 
 		 1343 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  30.49 
 
 		 1204 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  28.19 
 
 		 2030 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  27.22 
 
 		 925 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.93 
 
 		 1726 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  27.72 
 
 		 1748 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.12 
 
 		 1016 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  29.28 
 
 		 1613 aa  65.1  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 		 835 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.62 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  33.04 
 
 		 324 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.04 
 
 		 396 aa  56.2  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 		 986 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.42 
 
 		 688 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.14 
 
 		 933 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 		 689 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  27.68 
 
 		 634 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  29.27 
 
 		 876 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0795  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 		 385 aa  45.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0171943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1029 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 		 392 aa  44.7  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>