83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5990 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.86 
 
 		 1343 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.18 
 
 		 1797 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.78 
 
 		 2552 aa  99.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  27.34 
 
 		 1748 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 		 1016 aa  95.1  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 		 1773 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.83 
 
 		 835 aa  94.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  30 
 
 		 903 aa  93.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 1328 aa  90.5  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 		 1783 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  28.31 
 
 		 1351 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.98 
 
 		 1657 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.14 
 
 		 2713 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.04 
 
 		 1234 aa  82  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1329 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.13 
 
 		 991 aa  78.2  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  31.31 
 
 		 1613 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.39 
 
 		 1231 aa  77  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.31 
 
 		 1750 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27 
 
 		 3793 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 		 1726 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.85 
 
 		 822 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.72 
 
 		 1247 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.27 
 
 		 1288 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  30.41 
 
 		 1223 aa  72.4  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  28.84 
 
 		 1204 aa  72  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 2182 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  27.22 
 
 		 937 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.81 
 
 		 2171 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  26.05 
 
 		 1108 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 		 1008 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  25.05 
 
 		 697 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  28.63 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  27.78 
 
 		 1266 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.95 
 
 		 1002 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  37.72 
 
 		 1618 aa  58.9  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  28.65 
 
 		 1570 aa  58.9  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  27.23 
 
 		 1160 aa  58.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  25.94 
 
 		 2030 aa  58.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.98 
 
 		 794 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.27 
 
 		 509 aa  57  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28 
 
 		 799 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1313 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  22.22 
 
 		 720 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.25 
 
 		 1748 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1969 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0423  PA domain protein  26.61 
 
 		 2042 aa  53.9  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0201874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  30.54 
 
 		 1809 aa  53.9  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1976 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  25.1 
 
 		 1275 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  33.04 
 
 		 815 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1287 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25.35 
 
 		 1585 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 		 1776 aa  52  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.35 
 
 		 1217 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.24 
 
 		 686 aa  51.2  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.24 
 
 		 628 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.26 
 
 		 792 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.49 
 
 		 1345 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  36.08 
 
 		 531 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0534  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.63 
 
 		 698 aa  49.7  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.709674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.31 
 
 		 1474 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1245 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.78 
 
 		 997 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.21 
 
 		 576 aa  48.1  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  31.2 
 
 		 1233 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 637 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.29 
 
 		 429 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1518 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.92 
 
 		 1283 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.22 
 
 		 1295 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0676  proteinase, putative  37.84 
 
 		 885 aa  46.2  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  32.14 
 
 		 700 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  31.16 
 
 		 917 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.1 
 
 		 815 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  31.16 
 
 		 917 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 618 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  24.8 
 
 		 989 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.02 
 
 		 773 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  31.67 
 
 		 1570 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  31.67 
 
 		 1570 aa  44.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 		 986 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>