More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1792 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
686 aa  1398    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.49 
 
 
628 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0534  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.9 
 
 
698 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.709674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.58 
 
 
576 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
1008 aa  97.4  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.64 
 
 
327 aa  91.7  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.44 
 
 
997 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5026  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.97 
 
 
426 aa  88.6  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 
509 aa  87.8  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.04 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.06 
 
 
1783 aa  84.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.07 
 
 
653 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.85 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 
986 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  29.81 
 
 
485 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  31.82 
 
 
315 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.35 
 
 
1078 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.03 
 
 
1205 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.1 
 
 
1253 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.19 
 
 
1060 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  29.69 
 
 
307 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.08 
 
 
1324 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.47 
 
 
2552 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.44 
 
 
1361 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  31.44 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.04 
 
 
453 aa  79.7  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  31.92 
 
 
644 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.13 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  31.68 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
848 aa  78.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  28.83 
 
 
1351 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  31.3 
 
 
316 aa  77  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  31.3 
 
 
316 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  31.3 
 
 
316 aa  77  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  31.68 
 
 
316 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 
1405 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.39 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 
999 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.1 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  30.92 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
1262 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.84 
 
 
1797 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
1262 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1190  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  30.92 
 
 
316 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
1261 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
805 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  33.2 
 
 
339 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0271  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.41 
 
 
807 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.6 
 
 
1285 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.47 
 
 
1239 aa  71.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.97 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0754  alkaline serine protease  28.48 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.92 
 
 
749 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  30.23 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.13 
 
 
966 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.62 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.68 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3544  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.6 
 
 
711 aa  68.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26948  predicted protein  29.11 
 
 
1276 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.74 
 
 
915 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  29.1 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.53 
 
 
806 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  29.63 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  29.84 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.3 
 
 
1501 aa  67.8  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.62 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  41.59 
 
 
1570 aa  67.4  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.95 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  39.25 
 
 
917 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.12 
 
 
1773 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  38.74 
 
 
917 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  39.25 
 
 
917 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  38.74 
 
 
917 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  31.01 
 
 
397 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  29.06 
 
 
460 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.38 
 
 
635 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40456  predicted protein  25.95 
 
 
834 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  29.84 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  29.84 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  29.84 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  29.84 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 
483 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.96 
 
 
1172 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  29.84 
 
 
397 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
536 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 
669 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2279  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.41 
 
 
589 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.41 
 
 
595 aa  66.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  31.91 
 
 
397 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  37.38 
 
 
917 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  38.32 
 
 
917 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  37.27 
 
 
917 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  38.32 
 
 
917 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12480  subtilisin-like serine protease  28 
 
 
478 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.998475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>