39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4089 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  100 
 
 
720 aa  1470    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.39 
 
 
727 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  36.95 
 
 
989 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.33 
 
 
1068 aa  284  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.56 
 
 
665 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  33.41 
 
 
792 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  35.4 
 
 
990 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  29.45 
 
 
831 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  32.35 
 
 
661 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.3 
 
 
571 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.59 
 
 
618 aa  134  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.97 
 
 
608 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  26.68 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  23.82 
 
 
1295 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.81 
 
 
1657 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1118  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.55 
 
 
289 aa  59.7  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
1343 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.77 
 
 
1329 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  22.22 
 
 
925 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.85 
 
 
991 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  29.52 
 
 
3542 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.7 
 
 
3793 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  26.72 
 
 
2239 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  22.99 
 
 
1247 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.57 
 
 
1266 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  26.83 
 
 
1215 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  33.8 
 
 
1969 aa  47.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  22.38 
 
 
1474 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25 
 
 
1288 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  21.82 
 
 
1585 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  23.08 
 
 
1002 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  22.38 
 
 
1217 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  22.51 
 
 
1748 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  32.93 
 
 
1093 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6243  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.44 
 
 
312 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.649444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
1332 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  31.03 
 
 
1163 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  21.3 
 
 
807 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  28.57 
 
 
984 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>