57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5454 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  100 
 
 
792 aa  1589    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  31.46 
 
 
831 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.96 
 
 
727 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  42.91 
 
 
743 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  30.09 
 
 
661 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  39.22 
 
 
990 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  35.8 
 
 
989 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  41.04 
 
 
853 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.41 
 
 
720 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.46 
 
 
1068 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.9 
 
 
665 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  37.85 
 
 
1750 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.88 
 
 
571 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.86 
 
 
608 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.79 
 
 
3602 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.86 
 
 
618 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.07 
 
 
3191 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  23.25 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  40.98 
 
 
644 aa  65.1  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30 
 
 
1989 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.37 
 
 
2490 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.62 
 
 
2490 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  27.24 
 
 
2490 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  28.83 
 
 
2573 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.28 
 
 
2358 aa  54.7  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.28 
 
 
2490 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.28 
 
 
2358 aa  54.7  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  34.12 
 
 
5010 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  38.37 
 
 
1440 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  34.02 
 
 
1857 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  36.75 
 
 
1079 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 
5010 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  26.46 
 
 
2485 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  32.94 
 
 
5010 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  35 
 
 
1293 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  35.37 
 
 
5017 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  44.44 
 
 
1439 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  35.37 
 
 
5010 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  26.95 
 
 
2487 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  35.37 
 
 
5017 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  35.37 
 
 
5017 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  35.37 
 
 
5017 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  35.37 
 
 
5017 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  24.07 
 
 
4896 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.34 
 
 
3324 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  30.77 
 
 
2121 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  26.64 
 
 
983 aa  48.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  30.95 
 
 
2490 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  30.26 
 
 
2520 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  30.95 
 
 
2490 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  32.5 
 
 
2520 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  32.5 
 
 
2113 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.63 
 
 
1118 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  30.39 
 
 
2487 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  28.95 
 
 
1303 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  38.27 
 
 
826 aa  44.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  28.48 
 
 
587 aa  44.3  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>