28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2257 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  100 
 
 
831 aa  1702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  31.46 
 
 
792 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  35.86 
 
 
571 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.57 
 
 
727 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.84 
 
 
1068 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.82 
 
 
989 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.45 
 
 
720 aa  204  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.65 
 
 
665 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  38.81 
 
 
990 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  35.69 
 
 
853 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  35.33 
 
 
1750 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 
743 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  28.67 
 
 
661 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  30.2 
 
 
413 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.1 
 
 
618 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.46 
 
 
608 aa  81.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.26 
 
 
3602 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  33.04 
 
 
587 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  34.71 
 
 
1547 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.09 
 
 
3191 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  26.54 
 
 
2573 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1118  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.84 
 
 
289 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  24.54 
 
 
599 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2755  hypothetical protein  30.09 
 
 
292 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156672  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  31.45 
 
 
2270 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  34.88 
 
 
644 aa  47  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.8 
 
 
315 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.63 
 
 
3324 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>