79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4090 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  100 
 
 		 1068 aa  2195    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  37.02 
 
 		 989 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.6 
 
 		 727 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  37.04 
 
 		 2270 aa  301  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.85 
 
 		 720 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.15 
 
 		 3793 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.46 
 
 		 665 aa  248  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  32.84 
 
 		 831 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  36.18 
 
 		 990 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  31.89 
 
 		 792 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  33.93 
 
 		 661 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1547 aa  177  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.17 
 
 		 571 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.8 
 
 		 1247 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.24 
 
 		 1266 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.52 
 
 		 1748 aa  121  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  28.97 
 
 		 618 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.65 
 
 		 608 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  25.56 
 
 		 2402 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.01 
 
 		 991 aa  111  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  28.24 
 
 		 413 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.41 
 
 		 1657 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1329 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1064 aa  88.2  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.04 
 
 		 1288 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  25.74 
 
 		 1160 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.8 
 
 		 4071 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25.36 
 
 		 2833 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.13 
 
 		 2713 aa  85.5  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.15 
 
 		 1217 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.79 
 
 		 561 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.04 
 
 		 1474 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  24.75 
 
 		 1585 aa  82.4  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  31.23 
 
 		 1414 aa  81.6  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1287 aa  77.8  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  27.71 
 
 		 1275 aa  74.7  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32.72 
 
 		 3324 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  29.11 
 
 		 1108 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  24.32 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  24.55 
 
 		 3737 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.53 
 
 		 5453 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  24.73 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  25.57 
 
 		 2278 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1313 aa  64.7  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.62 
 
 		 4429 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1303 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1804 aa  61.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1488 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.2 
 
 		 1222 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1386 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.65 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  24.21 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  22.7 
 
 		 759 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  24.63 
 
 		 2262 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.93 
 
 		 1343 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.95 
 
 		 1002 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  23.94 
 
 		 1377 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  23.99 
 
 		 541 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.87 
 
 		 792 aa  52  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  26.03 
 
 		 490 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  23.89 
 
 		 890 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  27.27 
 
 		 1295 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1592  hypothetical protein  32.52 
 
 		 296 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.11 
 
 		 799 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  27.5 
 
 		 711 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  25.27 
 
 		 938 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.27 
 
 		 652 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  23.43 
 
 		 6497 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  23.43 
 
 		 1483 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  23.98 
 
 		 5544 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  26.32 
 
 		 2416 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4100  sialate O-acetylesterase  24.09 
 
 		 474 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  26.53 
 
 		 815 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  26.07 
 
 		 726 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.62 
 
 		 1679 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  23.02 
 
 		 885 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 		 683 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1602 aa  45.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25.68 
 
 		 774 aa  44.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>