36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4180 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  100 
 
 
990 aa  1994    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  36.24 
 
 
989 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  39.22 
 
 
792 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  42.98 
 
 
1750 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.03 
 
 
727 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.18 
 
 
1068 aa  218  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  35.4 
 
 
720 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  43.66 
 
 
743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  43.1 
 
 
853 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.67 
 
 
665 aa  181  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  31.01 
 
 
831 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  28.24 
 
 
661 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.83 
 
 
571 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  28.17 
 
 
413 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.97 
 
 
618 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.53 
 
 
608 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  30.53 
 
 
3602 aa  97.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  35.19 
 
 
644 aa  62.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5615  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.74 
 
 
312 aa  58.9  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1118  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.43 
 
 
289 aa  56.6  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.24 
 
 
587 aa  55.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  45.21 
 
 
915 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.87 
 
 
3191 aa  52  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  31.76 
 
 
826 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  48.33 
 
 
691 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  43.04 
 
 
1440 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.86 
 
 
2520 aa  48.5  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6243  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.67 
 
 
312 aa  48.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.649444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  24.39 
 
 
2573 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  36.46 
 
 
1100 aa  47.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4857  Sialate O-acetylesterase  24.73 
 
 
469 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000781027  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.83 
 
 
5010 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  24.11 
 
 
5010 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  44.07 
 
 
1079 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  25.54 
 
 
3324 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.33 
 
 
2121 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>