107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1910 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1117    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  34.19 
 
 		 2833 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.76 
 
 		 4071 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  33 
 
 		 496 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  32 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1287 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1488 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.31 
 
 		 1222 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1313 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  26.58 
 
 		 648 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.97 
 
 		 938 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  26.58 
 
 		 657 aa  98.2  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  27.13 
 
 		 886 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1245 aa  93.6  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  35.34 
 
 		 535 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.05 
 
 		 3682 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  33.62 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  37.58 
 
 		 642 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  33.04 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  41.76 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.38 
 
 		 1620 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.19 
 
 		 808 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  24 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  41.76 
 
 		 890 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  23.99 
 
 		 885 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.6 
 
 		 1140 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1163 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.91 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  24.45 
 
 		 3851 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.07 
 
 		 1602 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.14 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  31.62 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  34.48 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  33.59 
 
 		 1230 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.76 
 
 		 1345 aa  72.8  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.39 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  34.4 
 
 		 694 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  39.33 
 
 		 658 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.27 
 
 		 2270 aa  70.5  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  33.59 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  39.56 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  31.9 
 
 		 967 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  28.09 
 
 		 2980 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.75 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  29.17 
 
 		 2972 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  23.43 
 
 		 1606 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  34.31 
 
 		 963 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  34.31 
 
 		 969 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  33.71 
 
 		 598 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1547 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.61 
 
 		 3542 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  31.16 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  35.16 
 
 		 950 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.36 
 
 		 2377 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.16 
 
 		 1152 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.61 
 
 		 4429 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.6 
 
 		 1371 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  24.1 
 
 		 1162 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.78 
 
 		 799 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  36.49 
 
 		 751 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  25.28 
 
 		 742 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.38 
 
 		 4896 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  27.66 
 
 		 2772 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.67 
 
 		 2421 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1139 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.47 
 
 		 711 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.22 
 
 		 2454 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  22.31 
 
 		 989 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  34.44 
 
 		 1466 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.67 
 
 		 2367 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.22 
 
 		 2807 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.67 
 
 		 2411 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  22.92 
 
 		 627 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.08 
 
 		 3927 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.63 
 
 		 822 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  24.23 
 
 		 3324 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.71 
 
 		 991 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.76 
 
 		 1657 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.37 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  22.42 
 
 		 726 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.99 
 
 		 1068 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.19 
 
 		 1389 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  28.69 
 
 		 1097 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  33.68 
 
 		 1463 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  27.03 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  31.18 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  31.43 
 
 		 3958 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  31.25 
 
 		 871 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  31.46 
 
 		 676 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  39.13 
 
 		 3602 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.21 
 
 		 1987 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  22.73 
 
 		 750 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1329 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  23.01 
 
 		 774 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 3471 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.86 
 
 		 5544 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>