99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04505 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  100 
 
 		 1345 aa  2663    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.95 
 
 		 3793 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.9 
 
 		 2713 aa  139  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  26.04 
 
 		 1750 aa  122  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1245 aa  109  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1313 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  36.07 
 
 		 3089 aa  98.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.98 
 
 		 2833 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1059 aa  96.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  26.64 
 
 		 4071 aa  96.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1329 aa  89.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.78 
 
 		 1657 aa  89.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  25.92 
 
 		 1108 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1287 aa  82.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  25.85 
 
 		 3851 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26 
 
 		 3682 aa  79.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  23.52 
 
 		 885 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1547 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.7 
 
 		 1288 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.86 
 
 		 2270 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  24.76 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.4 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  29.58 
 
 		 496 aa  70.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  35.51 
 
 		 1441 aa  70.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.53 
 
 		 822 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  31.47 
 
 		 978 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.5 
 
 		 2262 aa  67.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  25.32 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  36.22 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.6 
 
 		 1222 aa  65.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  26.17 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1100 aa  65.1  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  24.92 
 
 		 797 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.89 
 
 		 2005 aa  63.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 750 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.95 
 
 		 1371 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  27.68 
 
 		 2772 aa  63.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  27.16 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  23.13 
 
 		 890 aa  58.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.71 
 
 		 938 aa  58.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.57 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  34.19 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.82 
 
 		 1607 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  25.65 
 
 		 1387 aa  57.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  23.73 
 
 		 2367 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  23.73 
 
 		 2411 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  34.88 
 
 		 3737 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  24.62 
 
 		 657 aa  57  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  23.67 
 
 		 2807 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  24.26 
 
 		 1602 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.23 
 
 		 1162 aa  56.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  23.67 
 
 		 2454 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.44 
 
 		 2421 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.39 
 
 		 886 aa  55.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.92 
 
 		 991 aa  55.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  24.12 
 
 		 648 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1969 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1980 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.23 
 
 		 792 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.89 
 
 		 1389 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.02 
 
 		 1620 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.96 
 
 		 1507 aa  53.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  36.84 
 
 		 3602 aa  53.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1139 aa  52.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1488 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.03 
 
 		 1266 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1461 aa  51.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.25 
 
 		 711 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  32.24 
 
 		 846 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.25 
 
 		 815 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  22.75 
 
 		 689 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  22.05 
 
 		 2272 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  24.93 
 
 		 5453 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 815 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  24.49 
 
 		 925 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  25.44 
 
 		 904 aa  50.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.96 
 
 		 3324 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.21 
 
 		 1300 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  25.21 
 
 		 2927 aa  49.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.27 
 
 		 1295 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  20.76 
 
 		 1862 aa  48.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.25 
 
 		 5745 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.74 
 
 		 3227 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1682 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30 
 
 		 4896 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.17 
 
 		 752 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02383  hypothetical protein  30 
 
 		 519 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0305216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  24.89 
 
 		 581 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.56 
 
 		 1987 aa  47  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.41 
 
 		 650 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1030 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 		 1501 aa  46.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  21.29 
 
 		 1094 aa  46.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.21 
 
 		 1217 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  29.71 
 
 		 511 aa  46.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  26.96 
 
 		 871 aa  45.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1032 aa  45.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.56 
 
 		 1414 aa  45.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  32.05 
 
 		 496 aa  45.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>