88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2904 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1387    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  32.49 
 
 		 650 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.47 
 
 		 642 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.83 
 
 		 1230 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  34.9 
 
 		 886 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  29.81 
 
 		 815 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  35.1 
 
 		 1222 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  38.18 
 
 		 2833 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  32.32 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  31.62 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  35.09 
 
 		 4071 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  35.71 
 
 		 535 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  35.77 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  34.43 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  38.68 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  31.3 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.85 
 
 		 1606 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  44.44 
 
 		 3542 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  34.71 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  33.94 
 
 		 890 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.19 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.88 
 
 		 4429 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35.54 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  28.31 
 
 		 3851 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  29.73 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.23 
 
 		 1987 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  35.59 
 
 		 808 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1287 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  36.27 
 
 		 1163 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.52 
 
 		 3227 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  36.59 
 
 		 1620 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  33.61 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 938 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  40.23 
 
 		 967 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  28.1 
 
 		 658 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.76 
 
 		 1140 aa  60.8  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  33.64 
 
 		 3682 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  29.77 
 
 		 1466 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.03 
 
 		 2980 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1313 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1371 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.18 
 
 		 1389 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  39.56 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.49 
 
 		 1602 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  36.96 
 
 		 2972 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1488 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.93 
 
 		 822 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  27.88 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  28.4 
 
 		 561 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.48 
 
 		 6497 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  30.34 
 
 		 429 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.11 
 
 		 627 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  35.96 
 
 		 794 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.56 
 
 		 3793 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  27.94 
 
 		 637 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1245 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.46 
 
 		 2377 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  35.16 
 
 		 797 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.19 
 
 		 1463 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1100 aa  48.9  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.27 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.36 
 
 		 711 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.41 
 
 		 3602 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  29.03 
 
 		 792 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.93 
 
 		 644 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.63 
 
 		 679 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.73 
 
 		 918 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  38.89 
 
 		 963 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  38.89 
 
 		 969 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 1483 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  30 
 
 		 3958 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.82 
 
 		 3927 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  25 
 
 		 958 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.22 
 
 		 4896 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.62 
 
 		 5745 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  27.66 
 
 		 1528 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1139 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  24.36 
 
 		 2296 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  38.1 
 
 		 1097 aa  44.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  26.32 
 
 		 791 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  35.11 
 
 		 751 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.22 
 
 		 3324 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.85 
 
 		 752 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  35.64 
 
 		 676 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  31.82 
 
 		 599 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>