237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3689 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  45.69 
 
 		 1222 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  100 
 
 		 938 aa  1944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  27.52 
 
 		 797 aa  265  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1488 aa  181  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  32.11 
 
 		 873 aa  166  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1313 aa  147  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1245 aa  147  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  30.29 
 
 		 4071 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  38.96 
 
 		 1140 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  31.27 
 
 		 2833 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  29.01 
 
 		 496 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  29.51 
 
 		 3851 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.99 
 
 		 886 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1287 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.65 
 
 		 3682 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.07 
 
 		 636 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  28.23 
 
 		 490 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  27.97 
 
 		 541 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.35 
 
 		 561 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  28.36 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31.37 
 
 		 540 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  28.17 
 
 		 1230 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  28.84 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  29.36 
 
 		 885 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.56 
 
 		 774 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.88 
 
 		 1466 aa  82  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  39.32 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  34.53 
 
 		 598 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.36 
 
 		 652 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  30.15 
 
 		 890 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  36.29 
 
 		 694 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.91 
 
 		 989 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  25.38 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.05 
 
 		 792 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  23.94 
 
 		 3542 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.31 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  25.6 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1620 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1064 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  23.76 
 
 		 662 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  24.64 
 
 		 1602 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  25.49 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  38.98 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  27.5 
 
 		 642 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.08 
 
 		 1371 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  23.75 
 
 		 1606 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  25.24 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  35.29 
 
 		 794 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 3793 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1163 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  39.73 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  24.27 
 
 		 1987 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  22.96 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  36.56 
 
 		 429 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 2972 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  22.09 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  24.7 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.26 
 
 		 1345 aa  65.1  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  25.51 
 
 		 1152 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.71 
 
 		 2980 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  28.47 
 
 		 950 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  25.56 
 
 		 532 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1547 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  30.65 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  33.06 
 
 		 4429 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.26 
 
 		 822 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  32.46 
 
 		 496 aa  63.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1111 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  23.08 
 
 		 808 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  30.51 
 
 		 968 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.34 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.04 
 
 		 2270 aa  61.6  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  30.71 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 		 2262 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1228 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  23.67 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  22.98 
 
 		 1389 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1259 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1329 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  23.46 
 
 		 2772 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  23.36 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.78 
 
 		 958 aa  56.2  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  24 
 
 		 315 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  26.72 
 
 		 967 aa  55.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.54 
 
 		 3324 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  48.21 
 
 		 918 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.64 
 
 		 2402 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0313  PKD domain-containing protein  40.26 
 
 		 401 aa  53.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  30.36 
 
 		 599 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.79 
 
 		 1002 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.36 
 
 		 2713 aa  52.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.28 
 
 		 1667 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  50.94 
 
 		 519 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  54.55 
 
 		 1830 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  26.02 
 
 		 969 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  26.02 
 
 		 963 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.28 
 
 		 861 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  33.71 
 
 		 749 aa  51.6  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>