167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1398 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  100 
 
 		 799 aa  1634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  38.6 
 
 		 792 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.97 
 
 		 822 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  34.46 
 
 		 794 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  38.01 
 
 		 636 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  34.52 
 
 		 735 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  42.44 
 
 		 751 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.48 
 
 		 637 aa  158  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 1371 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.85 
 
 		 1389 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  33.47 
 
 		 1162 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.49 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  30.07 
 
 		 615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1059 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.53 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.65 
 
 		 1657 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.94 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.52 
 
 		 886 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  35.33 
 
 		 2772 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.38 
 
 		 1602 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  39.72 
 
 		 2421 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  39.72 
 
 		 2454 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  39.72 
 
 		 2807 aa  96.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.6 
 
 		 1620 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1287 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  39.72 
 
 		 2367 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  39.72 
 
 		 2411 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.59 
 
 		 662 aa  95.1  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1064 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.25 
 
 		 1606 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1139 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  35.46 
 
 		 750 aa  91.3  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.52 
 
 		 3227 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1547 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  33.86 
 
 		 890 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  46.67 
 
 		 561 aa  90.1  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1259 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  25.53 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  34.85 
 
 		 2064 aa  87.4  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.47 
 
 		 1288 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1245 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.15 
 
 		 2713 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  25.32 
 
 		 1222 aa  84.7  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  30.11 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  35.94 
 
 		 808 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  33.71 
 
 		 885 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.72 
 
 		 2296 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.85 
 
 		 991 aa  77.8  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1488 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1329 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  29.65 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1313 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  26.4 
 
 		 963 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29.55 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.56 
 
 		 3793 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  39.02 
 
 		 711 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  27.6 
 
 		 1108 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.94 
 
 		 2927 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  25.47 
 
 		 969 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  41.43 
 
 		 4896 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  21.58 
 
 		 1140 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.56 
 
 		 2005 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  31.5 
 
 		 1266 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  42.11 
 
 		 3602 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.27 
 
 		 1466 aa  67.8  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  35.54 
 
 		 677 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  23.49 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.06 
 
 		 3682 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 		 315 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  35.87 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  34.71 
 
 		 4071 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  23.72 
 
 		 1152 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  30.5 
 
 		 1750 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.48 
 
 		 1526 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  36 
 
 		 3737 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.17 
 
 		 1345 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.72 
 
 		 1483 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30 
 
 		 815 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  39.05 
 
 		 797 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  42.03 
 
 		 2980 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.17 
 
 		 3324 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  24.22 
 
 		 3851 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  23.21 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1193 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  40.91 
 
 		 2588 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  37.08 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.45 
 
 		 1607 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.88 
 
 		 2270 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 599 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.71 
 
 		 3471 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  25 
 
 		 2972 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  34.18 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  34.74 
 
 		 938 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.63 
 
 		 2377 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.67 
 
 		 6497 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.26 
 
 		 1463 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1665 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  42.68 
 
 		 1230 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>