152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1688 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 1313 aa  2675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  35.33 
 
 		 3851 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1245 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  30.71 
 
 		 3682 aa  317  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.67 
 
 		 1222 aa  172  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1488 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  34.46 
 
 		 938 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  26.6 
 
 		 1140 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.38 
 
 		 2833 aa  119  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  29.73 
 
 		 946 aa  116  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.7 
 
 		 1620 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.52 
 
 		 4071 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.83 
 
 		 1345 aa  107  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  22.82 
 
 		 541 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1287 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1547 aa  103  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  25.52 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.85 
 
 		 3793 aa  98.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  28.65 
 
 		 652 aa  98.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  27.09 
 
 		 794 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  22.85 
 
 		 890 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.96 
 
 		 1602 aa  97.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29.02 
 
 		 490 aa  96.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  26.34 
 
 		 496 aa  94  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.38 
 
 		 886 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  24.55 
 
 		 2980 aa  92.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.21 
 
 		 792 aa  90.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.16 
 
 		 799 aa  89.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  39.42 
 
 		 1230 aa  89.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.6 
 
 		 1162 aa  88.6  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  29.8 
 
 		 532 aa  88.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 1152 aa  85.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.68 
 
 		 1606 aa  85.5  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  29.52 
 
 		 797 aa  85.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  25.95 
 
 		 2972 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.15 
 
 		 815 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.6 
 
 		 1657 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1064 aa  84.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  35.77 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.59 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1059 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.04 
 
 		 561 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  35.77 
 
 		 496 aa  79.7  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.59 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.24 
 
 		 1371 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.39 
 
 		 4429 aa  79.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  24.3 
 
 		 5453 aa  79  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.1 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1329 aa  78.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.91 
 
 		 2270 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1228 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  32.79 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  43.48 
 
 		 694 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.72 
 
 		 991 aa  75.1  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  27.76 
 
 		 1266 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  41.86 
 
 		 658 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1980 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  24.42 
 
 		 4978 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1139 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.49 
 
 		 503 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  34.09 
 
 		 885 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  41.89 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  25.56 
 
 		 581 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  25.13 
 
 		 3542 aa  72  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.22 
 
 		 1288 aa  71.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  23.31 
 
 		 808 aa  72  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  29.09 
 
 		 948 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  27.09 
 
 		 1108 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.83 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  22.91 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  27.53 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  24.29 
 
 		 2278 aa  66.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1163 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  27.68 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  38.75 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.5 
 
 		 3227 aa  64.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  32.98 
 
 		 640 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  27.59 
 
 		 2772 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.71 
 
 		 989 aa  64.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.44 
 
 		 1247 aa  64.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2367 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  28.27 
 
 		 774 aa  62.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  30.65 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.14 
 
 		 2411 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.34 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  36.11 
 
 		 1389 aa  62.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.66 
 
 		 2807 aa  62  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  27.06 
 
 		 750 aa  62  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1259 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  25.37 
 
 		 3471 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.76 
 
 		 2421 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.76 
 
 		 2454 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.97 
 
 		 968 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  24.4 
 
 		 1987 aa  60.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  34.34 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.04 
 
 		 1466 aa  58.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  32.65 
 
 		 969 aa  58.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.48 
 
 		 5544 aa  58.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  32.65 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>