142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0549 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 4429 aa  8695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.38 
 
 		 3542 aa  535  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.43 
 
 		 3737 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  31.19 
 
 		 3793 aa  288  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  29.43 
 
 		 2278 aa  261  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2005 aa  226  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  34.49 
 
 		 2980 aa  195  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  33.18 
 
 		 2972 aa  190  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  37.05 
 
 		 652 aa  187  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.33 
 
 		 2270 aa  186  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1969 aa  159  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1386 aa  158  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1303 aa  131  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  31.34 
 
 		 1657 aa  116  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  27.49 
 
 		 726 aa  114  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1329 aa  112  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  30.4 
 
 		 1748 aa  107  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.88 
 
 		 991 aa  105  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 		 3324 aa  101  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2411 aa  99  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2367 aa  98.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1313 aa  91.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.85 
 
 		 2454 aa  91.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.37 
 
 		 749 aa  90.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.37 
 
 		 2421 aa  90.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1976 aa  90.1  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  30.26 
 
 		 1288 aa  89.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  25.41 
 
 		 4071 aa  89.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1245 aa  87  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1547 aa  85.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  31.7 
 
 		 1160 aa  84.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.64 
 
 		 2807 aa  84  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  22.84 
 
 		 2772 aa  81.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  41.3 
 
 		 650 aa  81.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  41.86 
 
 		 1230 aa  80.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.27 
 
 		 2713 aa  80.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1084 aa  79.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.92 
 
 		 989 aa  80.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.81 
 
 		 662 aa  79  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  35.87 
 
 		 885 aa  78.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.45 
 
 		 1620 aa  78.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.24 
 
 		 1602 aa  78.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  25.74 
 
 		 1606 aa  77  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  40.22 
 
 		 642 aa  77  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1980 aa  75.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  23.52 
 
 		 766 aa  74.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  26.32 
 
 		 707 aa  75.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  38.04 
 
 		 1140 aa  74.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  28.08 
 
 		 886 aa  74.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  31.55 
 
 		 1266 aa  73.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1488 aa  73.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  37.36 
 
 		 890 aa  73.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  24.92 
 
 		 3851 aa  73.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  29.34 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.75 
 
 		 1371 aa  73.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1287 aa  72.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  24.33 
 
 		 627 aa  72  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1228 aa  71.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  29.23 
 
 		 5544 aa  71.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.4 
 
 		 808 aa  70.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1059 aa  70.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1259 aa  68.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  30.43 
 
 		 503 aa  68.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  37.08 
 
 		 496 aa  68.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.24 
 
 		 1247 aa  68.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  33.71 
 
 		 694 aa  68.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.42 
 
 		 1222 aa  68.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.67 
 
 		 1108 aa  68.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  35.23 
 
 		 598 aa  68.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  30.88 
 
 		 677 aa  67.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1163 aa  67  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.98 
 
 		 1466 aa  66.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  26.46 
 
 		 953 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  24.65 
 
 		 1987 aa  66.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  23.16 
 
 		 541 aa  66.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.4 
 
 		 1152 aa  65.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.07 
 
 		 938 aa  65.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  34.82 
 
 		 2833 aa  65.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  32.95 
 
 		 658 aa  64.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  32.95 
 
 		 532 aa  64.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.62 
 
 		 1068 aa  64.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  31.46 
 
 		 535 aa  63.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1067 aa  62.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  24.76 
 
 		 967 aa  63.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  36.56 
 
 		 950 aa  61.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  32.19 
 
 		 496 aa  60.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  31.11 
 
 		 636 aa  61.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1139 aa  61.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.16 
 
 		 1162 aa  60.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  35.87 
 
 		 1389 aa  60.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  25.31 
 
 		 871 aa  60.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  25.48 
 
 		 2416 aa  60.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  24.83 
 
 		 774 aa  59.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 968 aa  60.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.26 
 
 		 4896 aa  59.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  24.8 
 
 		 315 aa  59.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  29.5 
 
 		 1302 aa  58.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  34.74 
 
 		 490 aa  57.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  26.17 
 
 		 3958 aa  57.8  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  29.92 
 
 		 637 aa  57.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>