108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2273 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  100 
 
 
871 aa  1758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  43.16 
 
 
676 aa  83.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.82 
 
 
1371 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40.22 
 
 
3324 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.88 
 
 
2421 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.88 
 
 
2411 aa  74.7  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.88 
 
 
2367 aa  74.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.88 
 
 
2454 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.88 
 
 
2807 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  39.78 
 
 
2005 aa  72  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  36.45 
 
 
3793 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  37.63 
 
 
1259 aa  68.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  25.86 
 
 
2980 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  39.47 
 
 
1064 aa  67.8  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  40.86 
 
 
627 aa  67.8  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  40.95 
 
 
1665 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  30.56 
 
 
3737 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 
2588 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  41.67 
 
 
711 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  27.95 
 
 
750 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.16 
 
 
3602 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  22.09 
 
 
938 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  39.13 
 
 
852 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.31 
 
 
1547 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  30.71 
 
 
1634 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  37.89 
 
 
822 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.78 
 
 
637 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  39.02 
 
 
1389 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25.91 
 
 
774 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  35 
 
 
885 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.79 
 
 
1059 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  24.48 
 
 
2972 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  41.46 
 
 
815 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  38.75 
 
 
1483 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.72 
 
 
2772 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.31 
 
 
3542 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.91 
 
 
5745 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25 
 
 
1313 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.74 
 
 
3191 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.48 
 
 
4896 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  32.61 
 
 
561 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.92 
 
 
315 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.91 
 
 
652 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.99 
 
 
2833 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 
1386 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.99 
 
 
4071 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.67 
 
 
886 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  28.1 
 
 
2478 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  26.82 
 
 
797 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  26.34 
 
 
2927 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  34.09 
 
 
1066 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  25.88 
 
 
1140 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  23.77 
 
 
535 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.95 
 
 
792 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.67 
 
 
890 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  20.56 
 
 
1488 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  25.68 
 
 
1245 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  32.29 
 
 
2487 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  30.77 
 
 
969 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  35 
 
 
598 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  30.77 
 
 
963 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  37.23 
 
 
794 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  40 
 
 
1162 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36.92 
 
 
799 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.95 
 
 
1526 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.09 
 
 
3471 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.09 
 
 
2296 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  32.47 
 
 
658 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.07 
 
 
532 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  40 
 
 
640 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  32.69 
 
 
726 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  25.94 
 
 
989 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  32.11 
 
 
2267 aa  51.2  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
4429 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  36.36 
 
 
642 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.16 
 
 
503 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  30.77 
 
 
694 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  35.48 
 
 
2064 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  25.36 
 
 
1139 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  37.08 
 
 
534 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35 
 
 
3227 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  32.63 
 
 
1461 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  36.47 
 
 
751 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  28.72 
 
 
1980 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.53 
 
 
540 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.58 
 
 
429 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29.46 
 
 
490 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  30.15 
 
 
1111 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  24.65 
 
 
1163 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  30.21 
 
 
1230 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.5 
 
 
1222 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  34.52 
 
 
2402 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  31.25 
 
 
541 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  26.86 
 
 
2278 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.48 
 
 
991 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.49 
 
 
2270 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.8 
 
 
2377 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  32 
 
 
5298 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  23.27 
 
 
496 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.92 
 
 
1620 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>