163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3439 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  50.19 
 
 		 953 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  75.11 
 
 		 2367 aa  2043    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  79.38 
 
 		 2421 aa  2128    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  100 
 
 		 2454 aa  4883    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  72.39 
 
 		 2807 aa  1833    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  74.29 
 
 		 2411 aa  2046    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  41.62 
 
 		 976 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.01 
 
 		 2772 aa  414  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  47.68 
 
 		 750 aa  381  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1976 aa  370  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1059 aa  252  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  42.39 
 
 		 4978 aa  227  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  30.14 
 
 		 2418 aa  194  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  47 
 
 		 1259 aa  184  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 1371 aa  138  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.88 
 
 		 1389 aa  123  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1969 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.81 
 
 		 627 aa  120  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.63 
 
 		 1987 aa  117  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  32.42 
 
 		 1436 aa  116  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.63 
 
 		 822 aa  114  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  35.61 
 
 		 707 aa  109  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.99 
 
 		 1079 aa  99  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.51 
 
 		 2296 aa  97.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.99 
 
 		 2064 aa  97.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.54 
 
 		 3227 aa  96.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  26.52 
 
 		 4120 aa  96.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  39.72 
 
 		 799 aa  96.3  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.78 
 
 		 792 aa  95.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.8 
 
 		 2927 aa  94.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  34.81 
 
 		 1162 aa  90.5  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.11 
 
 		 637 aa  88.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1329 aa  88.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.7 
 
 		 636 aa  88.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.93 
 
 		 4896 aa  87.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.57 
 
 		 3793 aa  88.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.29 
 
 		 1526 aa  88.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.5 
 
 		 1466 aa  87.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  24.65 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.89 
 
 		 815 aa  87  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1547 aa  85.9  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  33.56 
 
 		 642 aa  85.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  37.01 
 
 		 2416 aa  85.5  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  37.61 
 
 		 3471 aa  83.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  30.18 
 
 		 885 aa  82.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1980 aa  82.4  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1287 aa  82.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  25.12 
 
 		 650 aa  82  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  29.92 
 
 		 808 aa  80.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.47 
 
 		 2377 aa  80.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.23 
 
 		 2713 aa  80.1  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1620 aa  79.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  79.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.61 
 
 		 890 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 1602 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.32 
 
 		 2270 aa  77.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.86 
 
 		 2005 aa  77.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.84 
 
 		 3602 aa  77.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.1 
 
 		 6497 aa  76.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  30.43 
 
 		 886 aa  76.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  35.46 
 
 		 4071 aa  75.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 1483 aa  75.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  42.31 
 
 		 3737 aa  74.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  25.66 
 
 		 3542 aa  75.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.25 
 
 		 3927 aa  73.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  27.88 
 
 		 871 aa  74.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1066 aa  73.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  30.45 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  29.02 
 
 		 1140 aa  72.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.7 
 
 		 1527 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  34.07 
 
 		 599 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.32 
 
 		 1657 aa  71.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1064 aa  70.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  26.42 
 
 		 4429 aa  70.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.56 
 
 		 5745 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1139 aa  68.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.22 
 
 		 561 aa  68.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  24.85 
 
 		 3834 aa  67  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.43 
 
 		 1606 aa  67  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  25.76 
 
 		 2402 aa  66.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  35 
 
 		 2022 aa  66.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  39.51 
 
 		 3958 aa  66.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  27.96 
 
 		 657 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  27.01 
 
 		 648 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  30.43 
 
 		 1097 aa  64.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2833 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.47 
 
 		 429 aa  64.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 2588 aa  64.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  32.08 
 
 		 711 aa  64.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1331 aa  63.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1245 aa  63.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.76 
 
 		 2262 aa  63.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  38.38 
 
 		 1193 aa  62.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  40.21 
 
 		 2267 aa  62.8  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1067 aa  61.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.65 
 
 		 3191 aa  61.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  41.79 
 
 		 852 aa  61.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2478 aa  61.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 4013 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.57 
 
 		 3324 aa  60.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>