127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0901 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  100 
 
 		 1139 aa  2323    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1193 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1163 aa  325  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  26.99 
 
 		 2402 aa  113  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  23.59 
 
 		 561 aa  112  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1064 aa  111  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.85 
 
 		 1162 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  51.22 
 
 		 1371 aa  102  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  45.88 
 
 		 627 aa  88.6  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  45.12 
 
 		 1389 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  24.12 
 
 		 815 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  40.24 
 
 		 3227 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  28.9 
 
 		 532 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  40 
 
 		 799 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  23.31 
 
 		 1463 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  47.31 
 
 		 1259 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.59 
 
 		 1526 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  22.67 
 
 		 794 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1059 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  27 
 
 		 2927 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 		 2296 aa  75.5  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.3 
 
 		 2262 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  40.96 
 
 		 822 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  34.65 
 
 		 792 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1313 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  23.57 
 
 		 885 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  24.15 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  25 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  42.53 
 
 		 750 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  41.46 
 
 		 637 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.05 
 
 		 2377 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  43.53 
 
 		 2421 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  40 
 
 		 3602 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  41.82 
 
 		 2588 aa  69.3  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  43.53 
 
 		 2454 aa  68.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  28.85 
 
 		 2478 aa  68.9  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  49.28 
 
 		 2411 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 3737 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  49.28 
 
 		 2367 aa  68.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  49.28 
 
 		 2772 aa  68.2  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  23.88 
 
 		 2713 aa  68.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  33.71 
 
 		 2267 aa  68.2  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  22.97 
 
 		 967 aa  68.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.37 
 
 		 4013 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  43.53 
 
 		 2807 aa  68.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  40.7 
 
 		 4896 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  41.43 
 
 		 3793 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.07 
 
 		 4071 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  32.79 
 
 		 2980 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  30.59 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.1 
 
 		 2005 aa  65.1  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 315 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  44.87 
 
 		 2487 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1066 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  22.31 
 
 		 1222 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1461 aa  62.4  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  22.25 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  35.23 
 
 		 599 aa  62  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.55 
 
 		 3927 aa  62  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  40.74 
 
 		 5298 aa  62  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  23.89 
 
 		 1097 aa  61.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.87 
 
 		 774 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  29.8 
 
 		 4429 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.33 
 
 		 1657 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1665 aa  60.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.52 
 
 		 1483 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.05 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  25.31 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.21 
 
 		 3191 aa  59.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1547 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.9 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  37.8 
 
 		 2064 aa  58.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  41.79 
 
 		 6497 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  29.82 
 
 		 2602 aa  58.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  38.37 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.47 
 
 		 636 aa  58.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 1152 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  24.14 
 
 		 1288 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  36.62 
 
 		 852 aa  57  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  21.59 
 
 		 890 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.47 
 
 		 3324 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.3 
 
 		 3471 aa  55.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  34.88 
 
 		 1140 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  41.79 
 
 		 969 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  41.79 
 
 		 963 aa  55.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  35.62 
 
 		 2364 aa  55.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  26.06 
 
 		 650 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  39.71 
 
 		 5745 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  35.62 
 
 		 860 aa  55.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  32.84 
 
 		 4044 aa  55.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1488 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.69 
 
 		 1620 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  36.05 
 
 		 808 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  31.71 
 
 		 751 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  33.04 
 
 		 2270 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  27.05 
 
 		 541 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  36.47 
 
 		 581 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1287 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  21.43 
 
 		 1345 aa  53.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  23.21 
 
 		 766 aa  52.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>