219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5863 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  100 
 
 		 3227 aa  6211    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  41.03 
 
 		 3089 aa  317  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  45.97 
 
 		 2296 aa  283  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 		 3066 aa  276  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  43.15 
 
 		 2927 aa  264  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  44.01 
 
 		 2802 aa  241  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.26 
 
 		 2886 aa  219  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.73 
 
 		 5442 aa  218  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.97 
 
 		 2156 aa  197  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  54.49 
 
 		 1526 aa  194  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  49.79 
 
 		 2192 aa  191  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.28 
 
 		 4480 aa  179  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.37 
 
 		 1699 aa  154  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  26.82 
 
 		 3864 aa  144  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  26.34 
 
 		 4830 aa  143  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1902 aa  136  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  35.8 
 
 		 1359 aa  136  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  26.99 
 
 		 7434 aa  129  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1066 aa  128  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  35.4 
 
 		 1424 aa  124  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  53.17 
 
 		 2207 aa  119  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  57.43 
 
 		 3089 aa  117  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  35.39 
 
 		 1428 aa  110  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  39.52 
 
 		 1371 aa  106  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.95 
 
 		 2377 aa  105  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  35.28 
 
 		 3477 aa  104  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  47.18 
 
 		 2042 aa  104  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.96 
 
 		 1162 aa  102  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  35.66 
 
 		 1389 aa  100  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  30.49 
 
 		 562 aa  100  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  34.75 
 
 		 852 aa  98.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.54 
 
 		 2421 aa  96.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.54 
 
 		 2367 aa  95.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.54 
 
 		 2454 aa  95.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.54 
 
 		 2411 aa  95.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.25 
 
 		 822 aa  95.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  35.09 
 
 		 750 aa  94  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.54 
 
 		 2807 aa  94.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  46.07 
 
 		 3737 aa  93.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  32.2 
 
 		 6497 aa  92.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.54 
 
 		 792 aa  92  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.52 
 
 		 799 aa  90.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  44.25 
 
 		 1762 aa  90.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1064 aa  90.5  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  43.48 
 
 		 4896 aa  89.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1059 aa  89.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.54 
 
 		 2503 aa  87.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  47.13 
 
 		 3927 aa  86.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.32 
 
 		 3544 aa  85.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.33 
 
 		 1848 aa  85.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  39.66 
 
 		 3471 aa  85.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.99 
 
 		 815 aa  86.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  33.81 
 
 		 627 aa  85.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  36.1 
 
 		 3699 aa  84.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  42.5 
 
 		 3602 aa  83.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  26.01 
 
 		 918 aa  83.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  31.03 
 
 		 1466 aa  82.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  24.77 
 
 		 2064 aa  81.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.17 
 
 		 1919 aa  81.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  39.8 
 
 		 2772 aa  81.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  30.32 
 
 		 1196 aa  81.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1139 aa  81.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  27.49 
 
 		 1483 aa  80.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 599 aa  80.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1825 aa  79.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  37.5 
 
 		 4044 aa  79.7  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  38.14 
 
 		 561 aa  79.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 808 aa  79  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  39.31 
 
 		 1061 aa  78.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  27.59 
 
 		 774 aa  78.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 3699 aa  78.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  33.33 
 
 		 3958 aa  77.4  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2005 aa  77.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0957  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 716 aa  77.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0225193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  46.34 
 
 		 978 aa  77  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  40.71 
 
 		 5298 aa  76.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.65 
 
 		 1606 aa  76.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1287 aa  75.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1657 aa  75.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.57 
 
 		 4071 aa  75.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.23 
 
 		 2117 aa  74.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  30 
 
 		 886 aa  74.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1259 aa  73.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.4 
 
 		 642 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.34 
 
 		 1620 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1980 aa  72.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1547 aa  72  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  29.05 
 
 		 3851 aa  72  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1193 aa  71.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  33.33 
 
 		 3682 aa  71.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  36.08 
 
 		 1097 aa  71.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  32.11 
 
 		 726 aa  70.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  43.68 
 
 		 315 aa  70.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  45.33 
 
 		 913 aa  70.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  34.95 
 
 		 2402 aa  70.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35 
 
 		 3191 aa  69.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.09 
 
 		 637 aa  68.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1538 aa  68.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.82 
 
 		 5745 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>