110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3743 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  100 
 
 		 1193 aa  2423    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  30 
 
 		 1139 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1163 aa  284  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.22 
 
 		 2402 aa  95.9  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  45.88 
 
 		 627 aa  94.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1064 aa  92  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  47.13 
 
 		 815 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  40.23 
 
 		 1389 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  25.95 
 
 		 5298 aa  79.3  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.78 
 
 		 1371 aa  78.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  27.25 
 
 		 792 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  38.2 
 
 		 1526 aa  75.1  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  36.36 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.47 
 
 		 822 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1547 aa  72.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  36.19 
 
 		 3227 aa  71.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.79 
 
 		 1463 aa  70.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  29.09 
 
 		 6497 aa  69.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  22.47 
 
 		 3958 aa  65.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  36.46 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 		 2927 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1066 aa  65.1  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1804 aa  64.7  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 799 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1059 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  31.97 
 
 		 3793 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 2296 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  38 
 
 		 2421 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  38.38 
 
 		 2367 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  38.38 
 
 		 2454 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  38.38 
 
 		 2411 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.94 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1315 aa  62  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  38.38 
 
 		 2807 aa  62  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  41.46 
 
 		 2772 aa  61.6  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.03 
 
 		 636 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  25.44 
 
 		 2972 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  24.45 
 
 		 1483 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  23.29 
 
 		 535 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1980 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1111 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 		 3471 aa  58.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  40.54 
 
 		 3602 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  24.18 
 
 		 2262 aa  58.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.97 
 
 		 991 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.15 
 
 		 1657 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1259 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  34.38 
 
 		 751 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 794 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  22.69 
 
 		 540 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  35.8 
 
 		 860 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  35.8 
 
 		 2364 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  35.87 
 
 		 2980 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  24.49 
 
 		 532 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  40 
 
 		 750 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33 
 
 		 2377 aa  55.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  34.09 
 
 		 2588 aa  55.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.42 
 
 		 2005 aa  53.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  30.33 
 
 		 4044 aa  53.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  24.28 
 
 		 1097 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  36.36 
 
 		 2064 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  34.72 
 
 		 599 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25.28 
 
 		 2833 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.29 
 
 		 429 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  22.89 
 
 		 890 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  31.71 
 
 		 726 aa  52.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  35.23 
 
 		 3542 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.58 
 
 		 503 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.21 
 
 		 774 aa  52  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  27.44 
 
 		 2478 aa  52.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  33.68 
 
 		 711 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  40.28 
 
 		 969 aa  52  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28.85 
 
 		 4896 aa  51.6  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  40.28 
 
 		 963 aa  51.6  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.21 
 
 		 2713 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.1 
 
 		 5544 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.31 
 
 		 3737 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1829 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  25.86 
 
 		 4071 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  34.04 
 
 		 1230 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  28.85 
 
 		 496 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.52 
 
 		 3324 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1313 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.72 
 
 		 1288 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  34.48 
 
 		 615 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  33.01 
 
 		 5745 aa  49.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.18 
 
 		 1140 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.78 
 
 		 1222 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  38.89 
 
 		 271 aa  48.5  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  24.19 
 
 		 694 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  39.47 
 
 		 2267 aa  48.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  32.53 
 
 		 873 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  24.41 
 
 		 766 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.41 
 
 		 3191 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  34.44 
 
 		 652 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.66 
 
 		 1606 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  24.49 
 
 		 2270 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  31.73 
 
 		 676 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1665 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>