23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1144 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.65 
 
 		 1800 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1315 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.17 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1980 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1163 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.22 
 
 		 711 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  37.89 
 
 		 421 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  40.38 
 
 		 5453 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1193 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  35.63 
 
 		 772 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  33.19 
 
 		 1716 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.63 
 
 		 819 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1139 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  45.9 
 
 		 551 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.96 
 
 		 1829 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  31.08 
 
 		 755 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1023 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  46.67 
 
 		 843 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.18 
 
 		 999 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  40.32 
 
 		 568 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  41.94 
 
 		 770 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  40.32 
 
 		 701 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>