18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0786 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 711 aa  1406    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  69.83 
 
 		 717 aa  922    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.53 
 
 		 1822 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.21 
 
 		 1829 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.38 
 
 		 1800 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1439 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1980 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1315 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  31.86 
 
 		 1716 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1439 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  29 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1238 aa  70.5  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  28.48 
 
 		 755 aa  68.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.16 
 
 		 5453 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  39.22 
 
 		 271 aa  53.9  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  24.66 
 
 		 1200 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.46 
 
 		 638 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>