42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1802 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  69.81 
 
 		 565 aa  770    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  62.26 
 
 		 570 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  62.92 
 
 		 568 aa  680    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  62.08 
 
 		 541 aa  688    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  64.39 
 
 		 551 aa  736    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1457    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  37 
 
 		 770 aa  277  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.7 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1023 aa  266  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  37.63 
 
 		 772 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  34.32 
 
 		 682 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  35.83 
 
 		 819 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  35.64 
 
 		 843 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  34.69 
 
 		 924 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  33.67 
 
 		 498 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  31.34 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.42 
 
 		 999 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  34.48 
 
 		 421 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.58 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2811  hypothetical protein  46.32 
 
 		 224 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  32.54 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  32.71 
 
 		 459 aa  160  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  30.9 
 
 		 593 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.14 
 
 		 1031 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4092  hypothetical protein  46.2 
 
 		 222 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00149098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  31.28 
 
 		 421 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  31.35 
 
 		 431 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  29.91 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  31.02 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  33.2 
 
 		 446 aa  128  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  29.55 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  27.69 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.98 
 
 		 701 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.46 
 
 		 1063 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  26.56 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.45 
 
 		 710 aa  87.4  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1011 aa  80.9  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  26.35 
 
 		 670 aa  76.6  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  27.75 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2780  hypothetical protein  25.84 
 
 		 215 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  48.75 
 
 		 314 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  54.05 
 
 		 14609 aa  48.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>