38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0236 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1016    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  39.11 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  37.66 
 
 		 682 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  40.34 
 
 		 772 aa  279  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  39.83 
 
 		 770 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1023 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  34.8 
 
 		 819 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  34.24 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  36.12 
 
 		 843 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  33.99 
 
 		 570 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  33.66 
 
 		 541 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  30.86 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  33.67 
 
 		 701 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  34.77 
 
 		 924 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.97 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  32.12 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  32.6 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.77 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  28.68 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.92 
 
 		 999 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  30.67 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  40.87 
 
 		 568 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  30.54 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  29.48 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  29.79 
 
 		 1031 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  29.12 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.66 
 
 		 1063 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  29.19 
 
 		 431 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  29.93 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  28.29 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  32.23 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  28.18 
 
 		 701 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  28.24 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  25.5 
 
 		 710 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.27 
 
 		 566 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  32.4 
 
 		 670 aa  90.1  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1011 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>