44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2792 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  56.48 
 
 		 924 aa  921    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 843 aa  1746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  56.51 
 
 		 819 aa  924    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  39.69 
 
 		 454 aa  260  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  39.73 
 
 		 772 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  39.91 
 
 		 770 aa  250  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  36.34 
 
 		 1023 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  35.64 
 
 		 701 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  33.22 
 
 		 570 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  34.81 
 
 		 551 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  35.94 
 
 		 568 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  35.91 
 
 		 541 aa  223  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  36.3 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  36.33 
 
 		 498 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  35.32 
 
 		 473 aa  205  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  32.79 
 
 		 565 aa  203  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.81 
 
 		 593 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  34.35 
 
 		 537 aa  163  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  34.22 
 
 		 421 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  28.2 
 
 		 999 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  44.89 
 
 		 450 aa  144  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  32.53 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  30.44 
 
 		 425 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  30.03 
 
 		 467 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  29.65 
 
 		 1031 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 1063 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  30.4 
 
 		 421 aa  124  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  32.96 
 
 		 446 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  28.85 
 
 		 427 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  31.19 
 
 		 421 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  30.17 
 
 		 431 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  28.8 
 
 		 425 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  28.81 
 
 		 701 aa  101  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.08 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  54.78 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1011 aa  77.4  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  29.22 
 
 		 670 aa  74.7  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09368  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.565145  hitchhiker  0.00269172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.76 
 
 		 1394 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  47.06 
 
 		 14609 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  46.38 
 
 		 462 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  33.9 
 
 		 486 aa  45.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3764  hypothetical protein  53.66 
 
 		 245 aa  45.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0555954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>