39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2788 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  61.57 
 
 		 568 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  62.32 
 
 		 551 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1111    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  62.8 
 
 		 565 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  60.41 
 
 		 570 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  62.08 
 
 		 701 aa  665    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  39.21 
 
 		 770 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.02 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  38.94 
 
 		 772 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1023 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  35.12 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  34.51 
 
 		 819 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  35.91 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  34.63 
 
 		 999 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  33.66 
 
 		 498 aa  188  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  32.19 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  32.7 
 
 		 924 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  31.78 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  33.05 
 
 		 593 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  32.54 
 
 		 421 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  33.27 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  32.65 
 
 		 450 aa  150  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  31.47 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  33.42 
 
 		 421 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  30.44 
 
 		 421 aa  136  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  30.43 
 
 		 431 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  32.74 
 
 		 1031 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  33.82 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  29.75 
 
 		 467 aa  130  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  29.72 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.43 
 
 		 1063 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.52 
 
 		 701 aa  114  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  26.59 
 
 		 425 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  25.74 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  25 
 
 		 1011 aa  83.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  28.45 
 
 		 710 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  48.75 
 
 		 314 aa  53.9  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  45.65 
 
 		 1394 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>