38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1517 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  94.3 
 
 		 1031 aa  804    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  100 
 
 		 450 aa  927    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  34.82 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  34.77 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  37.18 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  35.48 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  32.79 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  35.61 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  34.86 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  34.31 
 
 		 682 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  33.41 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  37.19 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  36.3 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  35.39 
 
 		 701 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  35.56 
 
 		 710 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  30.79 
 
 		 568 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  29.9 
 
 		 701 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  31.83 
 
 		 551 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  32.33 
 
 		 770 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  33.18 
 
 		 772 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  28.6 
 
 		 570 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  30.15 
 
 		 565 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  32.65 
 
 		 541 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1023 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  31.78 
 
 		 819 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  28.68 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1011 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  32.17 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.53 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.87 
 
 		 670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  29.15 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  31.56 
 
 		 593 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  44.89 
 
 		 843 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.65 
 
 		 999 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  35.09 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  43.75 
 
 		 924 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.25 
 
 		 1063 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  48.1 
 
 		 314 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>