38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3519 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  917    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  71.73 
 
 		 459 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  43 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  42.96 
 
 		 421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  42.14 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  43.37 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  39.04 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  39.78 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  37.74 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  36.3 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  35.73 
 
 		 1031 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  32.47 
 
 		 710 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  33.8 
 
 		 701 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  34.43 
 
 		 682 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.66 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  31.08 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1011 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  27.88 
 
 		 551 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  33.82 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  35.64 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  27.54 
 
 		 819 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  36.41 
 
 		 570 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  32.41 
 
 		 843 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  33.99 
 
 		 565 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  34.47 
 
 		 701 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  32.19 
 
 		 670 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  32.75 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  31.28 
 
 		 770 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  29.06 
 
 		 772 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  28.35 
 
 		 593 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  32.61 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  29.33 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  27.9 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  31.88 
 
 		 924 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1023 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  25.95 
 
 		 999 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.19 
 
 		 1063 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  30.86 
 
 		 522 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>