41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2151 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  69.81 
 
 		 701 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  59.79 
 
 		 568 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  67.8 
 
 		 570 aa  765    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1165    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  62.8 
 
 		 541 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  72.45 
 
 		 551 aa  815    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.31 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  35.82 
 
 		 770 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1023 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.81 
 
 		 772 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  33.01 
 
 		 682 aa  227  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  33.27 
 
 		 819 aa  219  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  32.49 
 
 		 843 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  32.12 
 
 		 924 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  32.3 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  30.58 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.74 
 
 		 999 aa  173  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.54 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.56 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  31.57 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  31.86 
 
 		 593 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  33.27 
 
 		 537 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  30.96 
 
 		 1031 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  31.49 
 
 		 421 aa  140  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  37.86 
 
 		 431 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  38.17 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  37.45 
 
 		 425 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  28.1 
 
 		 446 aa  130  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  26.93 
 
 		 467 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  26.63 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 		 1063 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  29.06 
 
 		 425 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  26.59 
 
 		 701 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.65 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1011 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  29.58 
 
 		 670 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.71 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  37.5 
 
 		 654 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  51.16 
 
 		 1480 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  48.75 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  56.76 
 
 		 14609 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>