61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2392 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 682 aa  1360    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  47.66 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  42.92 
 
 		 770 aa  301  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  39.63 
 
 		 772 aa  264  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  37.66 
 
 		 498 aa  257  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1023 aa  250  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  35.12 
 
 		 541 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.04 
 
 		 819 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  33.54 
 
 		 701 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  32.87 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  38.22 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  32.19 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  32.89 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  32.03 
 
 		 568 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  37.82 
 
 		 593 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  35.1 
 
 		 473 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  34.31 
 
 		 450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  36.3 
 
 		 843 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  34.77 
 
 		 431 aa  183  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  35.18 
 
 		 421 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.41 
 
 		 1031 aa  180  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  35.27 
 
 		 425 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.98 
 
 		 999 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  33.25 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  35.29 
 
 		 459 aa  172  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  32.63 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  33.11 
 
 		 924 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  32.96 
 
 		 710 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  35.82 
 
 		 701 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  35.53 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  32.93 
 
 		 427 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.79 
 
 		 1063 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.14 
 
 		 425 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  29.65 
 
 		 670 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.09 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1011 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  25.97 
 
 		 569 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  30.08 
 
 		 1236 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.8 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  38.04 
 
 		 1480 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  26.79 
 
 		 1206 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  49.06 
 
 		 654 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  47.76 
 
 		 1394 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  45.45 
 
 		 1332 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  50.59 
 
 		 314 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  41.27 
 
 		 14609 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.62 
 
 		 736 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  27.64 
 
 		 14944 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  48.33 
 
 		 462 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.84 
 
 		 766 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  30.91 
 
 		 317 aa  47.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  39.13 
 
 		 1293 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  22.94 
 
 		 777 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  58.33 
 
 		 2117 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  45.16 
 
 		 1487 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2957  hypothetical protein  47.83 
 
 		 221 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235898  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.62 
 
 		 812 aa  45.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 652 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  29.24 
 
 		 482 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  31.25 
 
 		 1581 aa  44.3  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>