60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0356 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  100 
 
 		 1011 aa  2028    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  51.11 
 
 		 701 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  74.26 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  46.72 
 
 		 710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  65.34 
 
 		 566 aa  476  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  42 
 
 		 467 aa  265  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  32.54 
 
 		 421 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  33.51 
 
 		 421 aa  194  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  32.82 
 
 		 431 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.82 
 
 		 425 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  30.71 
 
 		 427 aa  151  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  30.79 
 
 		 1031 aa  146  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.54 
 
 		 450 aa  141  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  32.17 
 
 		 446 aa  134  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.57 
 
 		 425 aa  128  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 		 1332 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  30.49 
 
 		 459 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  29.86 
 
 		 682 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  30.77 
 
 		 870 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  28.49 
 
 		 772 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  31.84 
 
 		 593 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.66 
 
 		 1029 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2119  hypothetical protein  49.09 
 
 		 360 aa  92  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.114431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  26.69 
 
 		 454 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  31.98 
 
 		 570 aa  88.6  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  29.14 
 
 		 885 aa  88.2  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  30.67 
 
 		 498 aa  87.4  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  37.04 
 
 		 826 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.32 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  28.44 
 
 		 770 aa  84.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  26.39 
 
 		 537 aa  84.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  28.98 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1023 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 669 aa  81.3  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  31.61 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  28.4 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  29.94 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  30.62 
 
 		 843 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  27.5 
 
 		 999 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  29.95 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2777  hypothetical protein  40.78 
 
 		 813 aa  72  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  29.65 
 
 		 701 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  30.95 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 		 566 aa  70.1  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  28.8 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.66 
 
 		 1063 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.33 
 
 		 12684 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  29.51 
 
 		 1050 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 659 aa  60.1  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  31.21 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  27.69 
 
 		 473 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 504 aa  56.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.67 
 
 		 512 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  32.03 
 
 		 518 aa  54.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  28.36 
 
 		 215 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  27.22 
 
 		 518 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1406 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>