37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4785 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  940    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  44.9 
 
 		 701 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  41.33 
 
 		 710 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  42 
 
 		 1011 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  43 
 
 		 670 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  39.79 
 
 		 421 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  38.32 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  40.93 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  39.9 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  39.01 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  38.15 
 
 		 566 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  37.63 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  37.74 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  37.22 
 
 		 1031 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  37.19 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  32.72 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  34.38 
 
 		 772 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  35.25 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  35.53 
 
 		 682 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  35.33 
 
 		 770 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  30.85 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1023 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.43 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  29.28 
 
 		 568 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  29.75 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  30.03 
 
 		 843 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  30.58 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  29 
 
 		 819 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  29.95 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  30.79 
 
 		 924 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  29.26 
 
 		 701 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  26.93 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.86 
 
 		 999 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  26.04 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  30.03 
 
 		 593 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  32.08 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 		 1063 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>