42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4281 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  100 
 
 		 454 aa  931    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  47.66 
 
 		 682 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  46.92 
 
 		 770 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  44.11 
 
 		 772 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  37.95 
 
 		 1023 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  39.11 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  36.02 
 
 		 541 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  35.88 
 
 		 701 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  35.1 
 
 		 551 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  35.89 
 
 		 565 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  35.33 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  34.94 
 
 		 568 aa  253  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  36.4 
 
 		 819 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  39.69 
 
 		 843 aa  242  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  35.59 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  34.57 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  32.79 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  37.39 
 
 		 924 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  35.73 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.75 
 
 		 1031 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.71 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.57 
 
 		 421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  32.35 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  34 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  34.6 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  32.75 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  32.07 
 
 		 999 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  35.25 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 701 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  31.71 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  31.08 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  29.38 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 1063 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  29.91 
 
 		 710 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.28 
 
 		 670 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  35.67 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1011 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 		 314 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  25.32 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  24.49 
 
 		 375 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  38.89 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.62 
 
 		 1480 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>