38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0937 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  100 
 
 		 427 aa  868    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  43.6 
 
 		 421 aa  346  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  44.12 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  44 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  42.69 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  45.3 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  40.36 
 
 		 459 aa  273  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  39.04 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  39.01 
 
 		 467 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  38.14 
 
 		 701 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  33.41 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  34.65 
 
 		 710 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  35.06 
 
 		 1031 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  32.93 
 
 		 682 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1011 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  31.71 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.38 
 
 		 670 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  28.12 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  33.59 
 
 		 772 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  29.72 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  28.85 
 
 		 843 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  27.92 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  28.29 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  29.89 
 
 		 566 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  27.53 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  27.18 
 
 		 570 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  27 
 
 		 701 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  26.39 
 
 		 565 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  27.79 
 
 		 819 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1023 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  27.47 
 
 		 924 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  29.72 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  30.18 
 
 		 770 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  29.35 
 
 		 593 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  26.44 
 
 		 999 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  26.23 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 		 1063 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  46.03 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>