60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4783 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  53.65 
 
 		 710 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1409    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  50.89 
 
 		 1011 aa  618  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  49.47 
 
 		 670 aa  327  5e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  47.35 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  44.9 
 
 		 467 aa  293  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  37.91 
 
 		 421 aa  243  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  36.89 
 
 		 425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  37.26 
 
 		 421 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  36.71 
 
 		 431 aa  235  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  38.14 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  37.58 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  35.39 
 
 		 450 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34.05 
 
 		 1031 aa  184  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  36.75 
 
 		 459 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  33.8 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  35.82 
 
 		 682 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  34.1 
 
 		 770 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  33.33 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  32.86 
 
 		 772 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  28.18 
 
 		 498 aa  115  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  27.52 
 
 		 541 aa  114  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  27.3 
 
 		 701 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 1332 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  30.5 
 
 		 421 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  28.48 
 
 		 593 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  27.12 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  28.81 
 
 		 843 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  32.21 
 
 		 473 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  27.3 
 
 		 568 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  27.2 
 
 		 570 aa  99  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  27.35 
 
 		 924 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  27.89 
 
 		 819 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  25.83 
 
 		 565 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1023 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  32.73 
 
 		 870 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.02 
 
 		 1029 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  32.73 
 
 		 580 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  27.22 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  28.77 
 
 		 999 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  31.33 
 
 		 566 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.47 
 
 		 12684 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.72 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2119  hypothetical protein  44.21 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.114431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  26.04 
 
 		 885 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  31.41 
 
 		 826 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.92 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.16 
 
 		 1063 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.98 
 
 		 497 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  27.23 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  27.44 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  29.26 
 
 		 1050 aa  60.8  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2777  hypothetical protein  40.24 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  29.53 
 
 		 652 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  26.8 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1406 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 671 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  26.7 
 
 		 504 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>