More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2229 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
659 aa  1301    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 
652 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
669 aa  339  8e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
671 aa  318  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
590 aa  170  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
572 aa  167  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
669 aa  166  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
477 aa  164  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 
657 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
475 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  40.07 
 
 
549 aa  154  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
691 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
1045 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
590 aa  151  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
580 aa  151  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
632 aa  151  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  37.31 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  37.31 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
568 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
655 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
346 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  41.63 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 
873 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  42.16 
 
 
326 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
570 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  42.93 
 
 
541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  33.95 
 
 
483 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
599 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
362 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
759 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
921 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
758 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
619 aa  134  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
478 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
352 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  39.11 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
516 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  38.12 
 
 
376 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
830 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  33.22 
 
 
331 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
627 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
649 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
546 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
875 aa  123  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
896 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  33.96 
 
 
373 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
1300 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
379 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
559 aa  112  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  38.94 
 
 
511 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  34.98 
 
 
945 aa  110  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  37.26 
 
 
505 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
991 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
685 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
358 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
700 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
458 aa  91.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
383 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
666 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  27.39 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  31.8 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
712 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
405 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
500 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.2 
 
 
611 aa  79.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
517 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  30.58 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  30.9 
 
 
497 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.46 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  33.33 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  32.42 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  32.95 
 
 
630 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
596 aa  77  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
816 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
1516 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
465 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.36 
 
 
1215 aa  77  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.85 
 
 
1121 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  30.28 
 
 
713 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
679 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
1181 aa  75.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.8 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.23 
 
 
1348 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
810 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
525 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>