55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2394 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
580 aa  1185    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  60.42 
 
 
566 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  34.5 
 
 
885 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
1332 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 
1029 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  34.13 
 
 
710 aa  90.5  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.49 
 
 
12684 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  29.94 
 
 
1011 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  29.89 
 
 
870 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  28.04 
 
 
826 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  31.72 
 
 
701 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.94 
 
 
834 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
671 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.11 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  32.61 
 
 
995 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  38.95 
 
 
527 aa  67.4  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  32.59 
 
 
2334 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  34.19 
 
 
409 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
669 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  30.41 
 
 
518 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  38.46 
 
 
670 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
659 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  34.34 
 
 
480 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.46 
 
 
1042 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  25.73 
 
 
215 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  34.95 
 
 
3507 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  27.78 
 
 
543 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.92 
 
 
14944 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  23.21 
 
 
1406 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  25.96 
 
 
779 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.94 
 
 
999 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.21 
 
 
1050 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  37.86 
 
 
1363 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.63 
 
 
448 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
652 aa  50.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.29 
 
 
1887 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.9 
 
 
1067 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  25.34 
 
 
770 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  34.69 
 
 
1973 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  32.77 
 
 
1199 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.34 
 
 
4433 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0773  Fibronectin type III domain protein  34.69 
 
 
554 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.310071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  37.5 
 
 
1380 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
673 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  32.32 
 
 
1363 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
776 aa  45.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.41 
 
 
649 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  29.61 
 
 
730 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
918 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  36.28 
 
 
548 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  25.3 
 
 
518 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  24.83 
 
 
209 aa  43.5  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.55 
 
 
512 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  40.21 
 
 
767 aa  43.5  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>