39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0773 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0773  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 554 aa  1095    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.310071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  33.2 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.54 
 
 		 9585 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  24.77 
 
 		 2068 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.81 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.28 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  26.43 
 
 		 1380 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  35.96 
 
 		 1753 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.24 
 
 		 3507 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  26.22 
 
 		 527 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  26.63 
 
 		 782 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.98 
 
 		 649 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.78 
 
 		 1735 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.77 
 
 		 918 aa  50.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  23.94 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.5 
 
 		 1363 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  26.3 
 
 		 771 aa  50.4  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  25.81 
 
 		 779 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  33.65 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.28 
 
 		 741 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 1973 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  26.4 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.27 
 
 		 1628 aa  47  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 		 211 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.08 
 
 		 2334 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  25.75 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.19 
 
 		 995 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  27.38 
 
 		 1363 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.33 
 
 		 1160 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  27.56 
 
 		 1247 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.41 
 
 		 459 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1062 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  30.05 
 
 		 670 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  27.86 
 
 		 404 aa  43.9  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  30.61 
 
 		 1462 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  36.26 
 
 		 409 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.81 
 
 		 2286 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>