21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1913 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  42.59 
 
 		 512 aa  165  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  37.14 
 
 		 518 aa  148  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  38.83 
 
 		 509 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.16 
 
 		 497 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2197  hypothetical protein  43.59 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.59 
 
 		 1029 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 671 aa  65.1  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 1332 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  24.31 
 
 		 566 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.61 
 
 		 701 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2198  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  29.03 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127585 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  25.73 
 
 		 580 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.59 
 
 		 710 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1011 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.53 
 
 		 834 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 826 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.76 
 
 		 12684 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  24.7 
 
 		 870 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  22.89 
 
 		 885 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>